Ngay khi nhậm chức, PGS.TS Lê Ngọc Tòng, Phó Hiệu trưởng ĐH Đông Đô có gửi thư tới toàn bộ sinh viên của trường, cho biết trường đang hoàn thiện thủ tục pháp lý bổ nhiệm Hiệu trưởng và Chủ tịch hội đồng quản trị.
ĐH Đông Đô thông tin tới sinh viên đã tốt nghiệp đại học, thạc sĩ, đang chờ cấp bằng, người bảo vệ luận văn chưa nhận được văn bằng do có sự thay đổi hiệu trưởng: Sau khi có quyết định của UBND TP. Hà Nội và Bộ GD&ĐT bổ nhiệm hiệu trưởng mới, trường sẽ ký các văn bằng gửi học viên, sinh viên đã tốt nghiệp.
Đối với văn bằng 2, ĐH Đông Đô sẽ đề xuất Bộ GD&ĐT đảm bảo quyền lợi cho học viên, công nhận văn bằng đã học của những người đã nhận bằng, chờ nhận bằng, chờ thi tốt nghiệp.Những sinh viên đang học, nhà trường sẽ hoàn thiện hồ sơ đào tạo, đề xuất Bộ GD&ĐT cho phép đào tạo hệ văn bằng 2 theo đúng quy định pháp luật. Sau khi Bộ GD&ĐT có chỉ đạo, nhà trường sẽ có phương hướng giải quyết ngay, đảm bảo quyền lợi chính đáng cho các sinh viên, học viên.
Bên cạnh việc bổ sung Ban giám hiệu và Hội đồng quản trị, trường ĐH Đông Đô cũng bổ sung nhân sự Phòng Đào tạo, Phòng Tài chính Kế toán. Trường thành lập ban giải đáp thắc mắc liên quan văn bằng 2 để tiếp sinh viên, phụ huynh, nhằm tăng cường đối thoại.
Mới đây, Bộ trưởng Bộ GD&ĐT Phùng Xuân Nhạ cũng chia sẻ quan điểm về hướng giải quyết với ĐH Đông Đô là trường sai đến đâu sẽ xử lý đến đó. ĐH Đông Đô phải nghiêm túc xử lý các sai phạm của mình và chịu trách nhiệm trước pháp luật về những sai phạm trong thời gian qua.
Trước đó, trong quá trình thanh tra, Bộ Giáo dục và Đào tạo phát hiện trường ĐH Đông Đô đào tạo "chui" 17 ngành đào tạo văn bằng 2, gồm: Công nghệ Kỹ thuật Môi trường, Công nghệ Sinh học, Công nghệ Thông tin, Kỹ thuật Điện tử Truyền thông, Kỹ thuật Xây dựng, Kiến trúc, Công nghệ Kỹ thuật Ôtô, Quản trị Kinh doanh, Tài chính Ngân hàng, Quan hệ Quốc tế, Luật kinh tế, Việt Nam học, Ngôn ngữ Anh, Ngôn ngữ Trung, Thông tin học, Kế toán, Quản lý Nhà nước.