Ra đời trong kháng chiến chống Mỹ cứu nước với tên gọi Đoàn Huấn luyện Trinh sát Đặc công Hải quân (13/4/1966), bằng phương pháp tác chiến “lấy ít đánh nhiều, luồn sâu đánh hiểm”, với ý chí kiên cường, tinh thần chiến đấu dũng cảm, mưu trí, sáng tạo, đoàn kết, không ngại gian khổ hy sinh, chiến sĩ đặc công Lữ đoàn 126 đã lập nhiều chiến công hiển hách, được ví như những “Yết Kiêu" của thời đại mới.
Phát huy truyền thống anh hùng, Lữ đoàn 126 không ngừng nâng cao và hoàn thiện công tác huấn luyện theo hướng “Tinh nhuệ, thiện chiến” và thực hiện tiêu chí 4 giỏi, “Bơi, lặn giỏi; bắn súng giỏi; võ thuật giỏi và rèn luyện thể lực giỏi”, làm chủ vũ khí trang bị, sẵn sàng đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ bảo vệ Tổ quốc trong tình hình mới.