Tại buổi lễ, TS Lê Công Lợi, Hiệu trưởng trường THPT chuyên Khoa học tự nhiên cho biết: 10 năm qua, trường THPT chuyên Khoa học tự nhiên có hơn 4.500 học sinh tốt nghiệp. Học sinh của trường xuất sắc giành được 23 huy chương Vàng Olympic quốc tế của tất cả 5 môn: Toán học, Tin học, Vật lí, Hóa học, Sinh học và nhiều huy chương Bạc, huy chương Đồng.
Tiêu biểu là học sinh Nguyễn Thế Hoàn lớp chuyên Toán khóa 2012 - 2015, Đinh Quang Hiếu lớp chuyên Hóa khóa 2014 - 2017, Phạm Đức Anh lớp chuyên Hóa khóa 2015- 2018, Bùi Hồng Đức lớp chuyên Tin khóa 2017-2020 đã 2 lần liên tiếp giành huy chương Vàng Olympic Toán học, Hóa học, Tin học quốc tế, nữ học sinh Nguyễn Phương Thảo chuyên Sinh khóa 2015 - 2018 đạt huy chương Vàng Olympic Sinh học quốc tế năm 2018 và giành điểm cao nhất cuộc thi. Đặc biệt, vừa qua học sinh Ngô Quý Đăng lớp chuyên Toán khóa 2019 - 2022 đã xuất sắc giành huy chương Vàng và xếp hạng 4/616 tại Olympic Toán học quốc tế năm 2020, đây là học sinh lớp 10 đầu tiên của Việt Nam được tham dự Olympic quốc tế.
Tiền thân của trường là lớp học chuyên Toán đặc biệt của Trường Đại học Tổng hợp Hà Nội, ra đời với 35 học sinh đến từ 10 tỉnh thành của miền Bắc. Lớp học đầu tiên này được khai giảng vào ngày 14/9/1965 tại Lò Đúc, Hà Nội. Các khóa tiếp theo là những sinh viên đặc biệt với ký hiệu lớp A0 của Trường Đại học Tổng hợp Hà Nội.
Các học sinh lớp chuyên Toán đã được đào tạo, bồi dưỡng thành những học sinh giỏi về Toán và được chọn gửi đi đào tạo đại học ở nước ngoài hoặc học tiếp trong nước để trở thành các chuyên gia khoa học kỹ thuật cho đất nước.
Từ những thành công của lớp chuyên Toán A0, lần lượt Khối chuyên Vật lí, Khối chuyên Hóa học, Khối chuyên Tin học, Khối chuyên Toán thành Khối chuyên Toán-Tin và Khối chuyên Sinh được thành lập, phát triển vào các năm 1985, 1992, 1993 và 1998.
Với bề dày đào tạo và thành tích, sáng 26/11, trường THPT chuyên Khoa học tự nhiên đã vinh dự đón nhận danh hiệu Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới và nhiều bằng khen tới tập thể cán bộ, giáo viên và học sinh của trường.