Trạm bơm Yên Sở có 20 tổ máy bơm, trong đó có 5 tổ máy bơm (trục đứng) có công suất 3m3/s và 15 tổ máy bơm (trục ngang) với công suất 5m3/s; cùng với đó là 2 kênh dẫn và 5 hồ chứa nước với tổng mức chứa khoảng hơn 4 triệu m3 nước.
Vào 7 giờ ngày 12/9, một số hồ thủy điện trên hệ thống sông Hồng đang vận hành xả lũ: Hồ Thác Bà mở 3 cửa xả mặt, hồ Tuyên Quang mở 3 cửa xả đáy. Mực nước hệ thống sông Hồng, sông Thái Bình đang ở mức cao: Sông Hồng tại Hà Nội là 11,20 m (trên báo động 2 là 0,70 m); sông Đuống tại Thượng Cát là 10,56 m (trên báo động 2 là 0,56 m), gây ngập lụt, ảnh hưởng đến đời sống sinh hoạt, sản xuất của nhân dân tại một số khu vực thuộc các quận, huyện của Hà Nội là: Tây Hồ, Ba Đình, Hoàn Kiếm, Long Biên, Đan Phượng, Phúc Thọ, Sơn Tây, Thanh Trì, Gia Lâm, Đông Anh...
Mực nước sông Nhuệ dâng cao dẫn đến tràn đê và sạt lở tại một số điểm thuộc địa bàn xã Đại Áng, huyện Thanh Trì. Mực nước sông Hồng ở mức trên báo động 2 gây ngập 40% khu dân cư và 100% diện tích sản xuất nông nghiệp ở bãi sông.
Tại huyện Thanh Oai, nước sông Nhuệ dâng cao nên đường dân sinh xã Cao Dương (đỉnh kè Mọc Xá) và cầu dân sinh đi sang Chương Mỹ bị ngập. Chính quyền địa phương xã đã cấm phương tiện lưu thông qua cầu để đảm bảo an toàn cho nhân dân và một số tuyến đường giao thông thôn, xóm. Xã Xuân Dương và xã Cự Khê đã bị ngập khoảng 30cm; 181 hộ dân xã Xuân Dương bị nước ngập sân khoảng 30 - 40 cm, một số hộ nước vào nhà khoảng 10 cm.
Tại xã Mỹ Hưng đã xử lý xong tình trạng nước sông Nhuệ tràn vào đường giao thông và đồng (tại vị trí các đầu ngõ với tổng chiều dài 30m) các thôn Đan Thầm, Quảng Minh và khu vực gần trạm bơm Đan Thầm (xã đã tiến hành đắp chống tràn).
Đối với tình trạng bể xả trạm bơm Đan Thầm vỡ 1 đoạn dài khoảng 10m và tràn bờ, Ban Chỉ huy Cụm chống úng số II, Ban Chỉ huy đê sông Nhuệ đoạn I đã chỉ đạo trực tiếp xã phối hợp với Xí nghiệp La Khê xử lý xong.
Đêm 11/9, tại xã xuất hiện đoạn sạt (sạt cũ phát sinh thêm) dài khoảng 8m, phía hạ lưu bờ tả sông Cụt Thạch Nham, làm vỡ mặt đường giao thông. Xã Mỹ Hưng đã tổ chức thông báo cấm phương tiện vận tải, ô tô qua khu vực nêu trên, tiếp tục theo dõi diễn biến cung sạt.
Ngoài ra, cống Đồng Cạn bị rò rỉ mang cống khiến nước từ sông Nhuệ chảy vào đồng; đoạn đê sông Nhuệ gần cống Đồng Cạn xã Liên Châu hiện bị tràn một số điểm. Huyện Thanh Oai đang chỉ đạo xã cho tiến hành xử lý ngay từ nguồn lực tại chỗ.