Cụ thể, tổng số tiền sử dụng sai nguồn và chi sai chế độ, đối tượng, định mức, tiêu chuẩn là trên 24,6 tỷ đồng, trong đó đã thu hồi trên 20 tỷ đồng. Tổng số tiền chi sai nguồn nhưng đảm bảo chế độ, đối tượng, định mức, tiêu chuẩn trên 31 tỷ đồng. Ban đã thu hồi là trên 8,4 tỷ đồng. Như vậy, đến thời điểm thanh tra, Ban đã thu hồi và nộp vào tài khoản của Thanh tra tỉnh, nộp về tài khoản của Ban tổng số tiền trên 28,9 tỷ đồng.
Về công tác thu, chi hoạt động tài chính trong giai đoạn 2010-2020, Ban Giải phóng mặt bằng và tái định cư thành phố Thanh Hóa không xây dựng, ban hành Quy chế chi tiêu nội bộ và quản lý tài sản công, hoặc đã xây dựng, ban hành Quy chế chi tiêu nội bộ và quản lý, sử dụng tài sản công, nhưng áp dụng một số căn cứ trong xây dựng Quy chế chi tiêu nội bộ đã hết hiệu lực.
Về chế độ kế toán, chứng từ, sổ sách, Ban Giải phóng mặt bằng và tái định cư thành phố Thanh Hóa vẫn còn một số chứng từ thanh toán thiếu chứng từ gốc, chưa đầy đủ thủ tục, như: Thiếu chữ ký người nhận tiền; thiếu lệnh điều xe, thiếu danh sách tham dự hội nghị. Các khoản chi tạm ứng kéo dài nhiều năm chưa làm thủ tục thanh toán tiền hoàn ứng; chưa mở sổ sách theo dõi, quản lý giá trị tài sản, giá trị hao mòn tài sản; theo dõi, quản lý trang thiết bị làm việc, theo dõi các khoản phải trả đối với các công nợ dịch vụ mua ngoài.
Thanh tra tỉnh cũng chỉ ra các sai phạm liên quan tới việc tiếp nhận, tuyển dụng, hợp đồng lao động và sử dụng lao động sai quy định hơn 80 trường hợp.
Với những sai phạm kể trên, Thanh tra tỉnh kiến nghị Ban Giải phóng mặt bằng và tái định cư thu hồi số tiền chi sai mục đích còn thiếu để hoàn trả kinh phí và quản lý, sử dụng theo đúng quy định. Chủ tịch UBND thành phố Thanh Hóa, Ban Giải phóng mặt bằng và tái định cư xây dựng Kế hoạch chấn chỉnh, khắc phục kịp thời những khuyết điểm, vi phạm theo kết luận của Thanh tra; tổ chức kiểm điểm, xử lý trách nhiệm đối với các tập thể, cá nhân có liên quan đến những khuyết điểm, vi phạm. Thanh tra tỉnh kiến nghị Chủ tịch UBND thành phố Thanh Hóa chấm dứt việc điều động, tuyển dụng, hợp đồng lao động về làm việc tại Ban Giải phóng mặt bằng và tái định cư đối với trường hợp không thuộc thẩm quyền.