Theo đó, Tòa án nhân dân tỉnh Đồng Nai tuyên phạt 13 năm tù đối với bị cáo Nguyễn Quang Tuấn (43 tuổi, nguyên Giám đốc Trung tâm Ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai; 12 năm tù đối với Nguyễn Hồng Đăng Khoa (42 tuổi, nguyên Giám đốc Công ty Nhà Nguyễn kiêm Giám đốc Công ty trách nhiệm hữu hạn Nông nghiệp công nghệ cao Trí Nguyễn, gọi tắt là Công ty Trí Nguyễn), cùng tội vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí.
Các bị cáo Lê Thị An Nhiên (41 tuổi, nguyên Phó Giám đốc Trung tâm Ứng dụng Công nghệ sinh học Đồng Nai) bị tuyên phạt 3 năm tù cho hưởng án treo; Nguyễn Ngọc Phương (50 tuổi, nguyên Phó Giám đốc Sở Khoa học - Công nghệ Đồng Nai) 2 năm tù cho hưởng án treo; Trần Thị Huỳnh Hương (45 tuổi, nguyên Trưởng phòng Kế hoạch - Tài chính Sở Khoa học - Công nghệ Đồng Nai) 1 năm 6 tháng tù cho hưởng án treo.
Hội đồng xét xử nhận định, hành vi của ông Phạm Văn Sáng, nguyên Giám đốc Sở Khoa học - Công nghệ Đồng Nai và Nguyễn Quang Tuấn, Nguyễn Hồng Đăng Khoa đã cố ý xây dựng 5 khối nhà màng của 2 dự án “Nhà màng VietGAP” và “Nhà màng nông nghiệp” trái quy định pháp luật trên đất của Công ty Trí Nguyễn, để bị cáo Khoa chiếm dụng, phục vụ hoạt động sản xuất, kinh doanh của Công ty Trí Nguyễn, gây thất thoát, thiệt hại cho ngân sách Nhà nước hơn 28 tỷ đồng. Trong đó, Phạm Văn Sáng là người chủ mưu cầm đầu, còn Tuấn và Khoa giữ vai trò giúp sức, thực hành tích cực.
Hội đồng xét xử nhận định, hành vi của các bị cáo Tuấn, Khoa là đặc biệt nghiêm trọng, gây nguy hiểm cho xã hội, làm thất thoát tài sản của Nhà nước, ảnh hưởng xấu đến hoạt động cũng như niềm tin của nhân dân đối với các cơ quan Nhà nước. Các bị cáo đã thực hiện hành vi phạm tội nhiều lần, cần áp dụng mức hình phạt tương xứng với tính chất, mức độ phạm tội mà các bị cáo đã gây ra.
Riêng đối với các bị cáo Phương, Nhiên, Hương, với nhiệm vụ được giao đã ký các giấy tờ, hồ sơ sai quy định nên bị truy tố về tội thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng.
Theo cáo trạng của Viện Kiểm sát nhân dân tỉnh Đồng Nai, năm 2008 Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai thành lập Trung tâm Ứng dụng Công nghệ sinh học Đồng Nai và bổ nhiệm Tuấn làm Giám đốc, Nhiên làm Phó Giám đốc. Quá trình lập hồ sơ, triển khai thực hiện dự án “Nhân rộng mô hình sản xuất rau, quả trong nhà màng theo tiêu chuẩn VietGAP” và dự án “Nhà màng nông nghiệp”, các bị can: Tuấn, Khoa và một số cá nhân khác đã có nhiều sai phạm trong việc quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước, không thực hiện đúng nhiệm vụ được giao, gây thiệt hại đặc biệt nghiêm trọng cho ngân sách Nhà nước với tổng số tiền hơn 28 tỷ đồng.
Cụ thể, dự án “Nhân rộng mô hình sản xuất rau, quả trong nhà màng theo tiêu chuẩn VietGAP” được Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai phê duyệt năm 2015, thực hiện tại xã Xuân Đường (huyện Cẩm Mỹ) và giao trách nhiệm cho nguyên Giám đốc Sở Khoa học-Công nghệ Phạm Văn Sáng tổ chức quản lý, triển khai thực hiện với tổng kinh phí gần 87 tỷ đồng. Trong đó, ngân sách Nhà nước hơn 16 tỷ đồng và kinh phí khác gần 71 tỷ đồng (do Công ty Trí Nguyễn bỏ vốn đầu tư). Thời gian thực hiện dự án từ năm 2015-2018. Dù hồ sơ dự án này chưa có đơn đăng ký thực hiện đề tài; giấy xác nhận phối hợp nghiên cứu nhiệm vụ khoa học công nghệ cấp tỉnh… nhưng ông Sáng vẫn đưa hồ sơ này vào xét duyệt và thống nhất thông qua thuyết minh dự án.
Ông Sáng và Tuấn thực hiện xây lắp 3 nhà màng nhưng không triển khai thực hiện các giai đoạn lập, thẩm định, phê duyệt thiết kế, tổ chức thi công… mà giữa 3 bị can Sáng, Tuấn, Khoa, thỏa thuận bằng miệng về việc hợp tác giữa Trung tâm Ứng dụng Công nghệ sinh học Đồng Nai và Công ty Trí Nguyễn (do Khoa góp vốn 17,5 tỷ đồng và bà Nguyễn Thị Xuân, vợ ông Sáng góp vốn 12,5 tỷ đồng).
Trung tâm Ứng dụng Công nghệ sinh học Đồng Nai góp vốn bằng khối nhà màng còn Công ty Trí Nguyễn góp đất đã thuê để thực hiện dự án. Do đó, ông Sáng và các bị can Tuấn, Khoa đã cố ý lắp dựng 3 khối nhà màng trái quy định.
Sau khi nghiệm thu hoàn thành công trình, 3 khối nhà màng này đã bị Khoa chiếm dụng phục vụ hoạt động sản xuất, kinh doanh của Công ty Trí Nguyễn, gây thiệt hại cho tài sản Nhà nước hơn 14 tỷ đồng.
Ngoài ra, năm 2015, Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai phê duyệt dự án “Nhà màng nông nghiệp” với tổng mức đầu tư 14,5 tỷ đồng tại xã Xuân Đường (huyện Cẩm Mỹ). Với cách làm tương tự, ông Sáng và các bị can Tuấn, Khoa đã cùng nhau xây lắp 2 khối nhà màng trong dự án Nhà màng nông nghiệp và để cho Công ty Trí Nguyễn chiếm dụng, gây thiệt hại tài sản của Nhà nước gần 14 tỷ đồng.
Cáo trạng xác định các bị cáo xây dựng 5 khối nhà màng trái quy định, gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước hơn 28 tỷ đồng, một số bị can khác là Phương, Nhiên, Hương, với chức năng, nhiệm vụ được giao đã thiếu trách nhiệm, gây hậu quả nghiêm trọng.
Riêng bị cáo Phạm Văn Sáng, trong thời gian tạm đình chỉ việc giải quyết kiến nghị khởi tố đã bỏ trốn khỏi nơi cư trú và đang bị truy nã quốc tế.