Tòa đã tuyên án phạt 9 bị cáo gồm: Quản Trọng Công (sinh năm 1991, ở quận Đống Đa) 26 tháng tù; Nguyễn Hoàng Anh (sinh năm 1991, ở quận Hoàng Mai), Nguyễn Thị Minh Châu (sinh năm 1971, ở huyện Thanh Trì), Nguyễn Văn Tuấn (sinh năm 1970, ở huyện Thanh Trì), Nguyễn Thu Huyền (sinh năm 1979, ở quận Hoàng Mai) cùng lĩnh 20 tháng tù nhưng cho hưởng án treo; Đào Thị Ánh (sinh năm 1993, ở quận Hoàng Mai), Thào Thị Phương (sinh năm 1961, ở quận Nam Từ Liêm) cùng bị phạt 18 tháng tù treo; Vũ Minh Tín (sinh năm 1994, ở quận Hoàng Mai), Nguyễn Lệ Chi (sinh năm 1997, ở quận Đống Đa) đều lĩnh 10 tháng tù nhưng cho hưởng án treo về cùng tội “Mua bán trái phép hóa đơn”.
Riêng bị cáo Lưu Đình Cải (sinh năm 1989, Giám đốc Công ty Trách nhiệm hữu hạn xây dựng Việt Panel) bị phạt tiền 120 triệu đồng về tội “Trốn thuế”.
Theo cáo trạng, khoảng cuối năm 2015, Quản Trọng Công cùng dì ruột mua hóa đơn Giá trị gia tăng để bán lại cho khách kiểm lời nên biết cách thức mua bán trái phép hóa đơn. Đến năm 2018, Công tự mình tổ chức việc mua bán trái phép hóa đơn.
Để thực hiện hành vi, Công rủ Hoàng Anh, Ánh, Tín, Chi cùng tham gia. Kết quả điều tra xác định, từ 2018 - 2019, Công và đồng phạm bán khoảng 400 hóa đơn giá trị gia tăng khống cho các tổ chức, cá nhân, thu lời bất chính khoảng 300 triệu đồng.
Tiến hành khám xét chỗ ở, làm việc của Công, cơ quan điều tra thu giữ 17 con dấu của 15 công ty; 33 mặt dấu hình tròn trên có khắc tên công ty, mã số doanh nghiệp của 16 công ty (có nhiều mặt dấu trùng tên công ty); 27 dấu chức danh giám đốc, kế toán; thu giữ 17 giấy đăng ký kinh doanh của 11 công ty, giấy nộp tiền…
Ngoài ra, cáo trạng thể hiện, khoảng tháng 7/2018, Hoàng Anh có nhu cầu kinh doanh nên mua lại Công ty Trách nhiệm hữu hạn truyền thông Linknew và đứng tên Giám đốc. Trong quá trình hoạt động, do có vướng mắc kế toán nên Hoàng Anh nhờ Công tư vấn. Công chỉ cho Hoàng Anh cách thức bán hóa đơn giá trị gia tăng.
Để có hóa đơn đầu vào để hạch toán thuế, Hoàng Anh mua của Công hóa đơn giá trị gia tăng của Công ty Trách nhiệm hữu hạn AD-VIET, Công ty Cổ phần công nghệ xanh Đại Toàn Cầu với giá 1%/ tổng giá trị số tiền ghi trên hóa đơn; sau đó bán lại cho các khách hàng có nhu cầu với giá 3%/tổng giá trị số tiền ghi trên hóa đơn.
Cơ quan tố tụng xác định Hoàng Anh đã bán 42 hóa đơn giá trị gia tăng khống với số tiền ghi trên hóa đơn là hơn 14 tỷ đồng, thu lời bất chính hơn 284 triệu đồng.
Qua xác minh các doanh nghiệp đã sử dụng hóa đơn khống cho thấy, trước thời điểm cơ quan có thẩm quyền ra quyết định xử phạt, các doanh nghiệp này đã loại bỏ toàn bộ số hóa đơn bất hợp pháp và nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước. Do đó, Cơ quan điều tra không xem xét xử lý.
Trong vụ án này, Thào Thị Phương, Giám đốc Công ty Cổ phần công nghệ xanh Đại Toàn Cầu và Nguyễn Lệ Chi cũng giúp sức cho Công bán hóa đơn trái phép.
Ngoài ra, Cơ quan điều tra làm rõ hành vi bán trái phép hóa đơn giá trị gia tăng của các bị cáo Nguyễn Văn Tuấn, Giám đốc Công ty xuất nhập khẩu Bảo Tuấn, Nguyễn Thị Minh Châu (vợ Tuấn) và Nguyễn Thu Huyền. Theo đó, vợ chồng Tuấn sử dụng pháp nhân Công ty xuất nhập khẩu Bảo Tuấn để bán cho Huyền 103 hóa đơn giá trị gia tăng khống ghi tổng số tiền hơn 42,5 tỷ đồng, thu lời bất chính khoảng 300 triệu đồng. Còn Huyền bán lại hóa đơn giá trị gia tăng khống cho Công ty Trách nhiệm hữu hạn xây dựng Việt Panel và công ty khác với giá từ 8 - 8,5% để thu lời 150 triệu đồng.
Mở rộng điều tra, Cơ quan công an còn phát hiện bị cáo Lưu Đình Cải (Giám đốc Công ty trách nhiệm hữu hạn Xây dựng Việt Panel) đã có hành vi mua, sử dụng 34 hóa đơn bất hợp pháp để kê khai trốn thuế. Thông qua Nguyễn Thu Huyền, Cải mua hóa đơn của Công ty xuất nhập khẩu Bảo Tuấn với tổng số tiền ghi trên hóa đơn là hơn 3,1 tỷ đồng với tiền thuế giá trị gia tăng là hơn 313 triệu đồng.
Cải đã sử dụng các hóa đơn này để kê khai chi phí đầu vào nhằm giảm số thuế Công ty trách nhiệm hữu hạn Xây dựng Việt Panel phải nộp. Với hành vi trên, Cải trốn thuế số tiền hơn 260 triệu đồng. Hiện Cải đã nộp lại toàn bộ số tiền trên để khắc phục hậu quả.