Theo quan điểm của Viện Kiểm sát, vụ án có tính chất đặc biệt nghiêm trọng; các bị cáo phạm tội với lỗi cố ý trực tiếp vì động cơ vụ lợi và dùng nhiều thủ đoạn gian dối trong việc cấp phép kit xét nghiệm COVID-19 cho Công ty Việt Á rồi bán thương mại. Các bị cáo thừa nhận hành vi phạm tội, xin giảm nhẹ và phía Viện Kiểm sát nhận thấy, kháng cáo của họ đều hợp lệ theo quy định.
Đại diện Viện Kiểm sát đề nghị giảm mức án cho bị cáo Phan Quốc Việt (cựu Chủ tịch Việt Á) từ 25 năm tù xuống còn 22 năm tù. Bị cáo Trịnh Thanh Hùng (cựu Phó vụ trưởng Vụ Các ngành Kinh tế - kỹ thuật, Bộ Khoa học và Công nghệ) được đề nghị giảm từ 15 năm tù xuống 13 năm tù.
Bị cáo Hồ Anh Sơn (cựu Phó Giám đốc Viện nghiên cứu Y dược học quân sự, Học viện Quân y) được đề nghị giảm từ 12 năm tù xuống 10 năm tù. Bị cáo Nguyễn Văn Hiệu (cựu Trưởng phòng Trang bị Vật tư, Học viện Quân y) được đề nghị giảm án từ 7 năm tù xuống còn 5 năm tù. Các bị cáo Lê Trường Minh (cựu Trưởng Ban Hóa dược, Học viện Quân y) và Vũ Đình Hiệp (cựu Phó tổng giám đốc Công ty Việt Á) cùng được đề nghị giảm từ 6 năm tù xuống 4 năm tù. Riêng bị cáo Ngô Anh Tuấn (cựu Trưởng Phòng Tài chính, Học viện Quân y) được đề nghị giảm án từ 4 năm tù xuống 2 năm tù treo.
Theo đại diện Viện Kiểm sát, bị cáo Phan Quốc Việt (Tổng Giám đốc công ty Việt Á) có tình tiết mới là đại diện Công ty Việt Á đã nộp 200 triệu đồng khắc phục hậu quả cho bị cáo; ghi nhận Phan Quốc Việt đóng góp tích cực, giúp đẩy lùi dịch bệnh trên cả nước; bị cáo thành khẩn, ăn năn… nên cũng cần giảm nhẹ hình phạt.
Đối với bị cáo Trịnh Thanh Hùng, đại diện Viện Kiểm sát cho biết, trước phiên phúc thẩm, gia đình cung cấp thêm bằng khen của vợ con, bố mẹ vợ, đơn đề nghị của Thứ trưởng Bộ Khoa học và Công nghệ đề nghị giảm nhẹ cho bị cáo. Ngoài ra, bị cáo Hùng đã khắc phục hậu quả; thể hiện sự thành khẩn, ăn năn hối cải tại tòa; tích cực làm sáng tỏ vụ án; có thành tích trong công tác… Như vậy, Viện Kiểm sát cho rằng có căn cứ giảm hình phạt cho bị cáo.
Còn bị cáo Hồ Anh Sơn có tình tiết giảm nhẹ mới là bằng khen của Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Giang; có cống hiến trong giáo dục, phòng chống dịch bệnh… Đại diện Viện Kiểm sát cho rằng có căn cứ chấp nhận kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt của bị cáo Sơn.
Đối với các bị cáo Nguyễn Văn Hiệu, Ngô Anh Tuấn, Lê Trường Minh, Vũ Đình Hiệp, đại diện Viện Kiểm sát đưa ra quan điểm: Cả 4 người đều thành khẩn khai báo, ăn năn hối cải, có thành tích trong công tác…
Đối với kháng cáo phần trách nhiệm dân sự của Công ty Việt Á, đại diện Viện Kiểm sát cho rằng, các tình tiết đều đã được cấp sơ thẩm xem xét nên không có căn cứ chấp nhận, đề nghị Tòa án cấp phúc thẩm giữ nguyên nội dung mà bản án sơ thẩm đã tuyên.
Trước đó, Tòa án cấp sơ thẩm xác định Học viện Quân y (nguyên đơn dân sự) bị thiệt hại hơn 46 tỷ đồng, đã được bồi thường hơn 10 tỷ đồng. Do vậy, Công ty Việt Á (bị đơn dân sự) phải bồi hoàn hơn 31 tỷ đồng và bị cáo Hồ Anh Sơn bồi thường hơn 1,6 tỷ đồng.