Trong đó, 9 bị can gồm: Lê Trúc Bình, Lê Văn Ly, Thái Xuân Hùng, Thái Xuân Cần, Thái Ngọc Tân, Phạm Văn Lâm, Lê Văn Liên (cùng trú xã An Xuân, huyện Tuy An) và Nguyễn Văn Nhân, Đinh Quốc Việt (cùng trú xã Sơn Long, huyện Sơn Hòa) bị khởi tố về tội "Hủy hoại rừng" quy định tại điểm d khoản 2 Điều 243 Bộ luật Hình sự; 2 bị can Sô Minh Hữu và Lê Thanh Dũng cùng trú xã Sơn Định bị khởi tố về tội "Hủy hoại rừng" quy định tại điểm b khoản 1 Điều 243 Bộ luật Hình sự.
Ngoài ra, Cơ quan Cảnh sát điều tra còn khởi tố bị can đối với Đặng Dương (kiểm lâm địa bàn) và Nguyễn Văn Hoài (cán bộ lâm nghiệp xã Sơn Định) về tội "Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng" quy định tại điểm c khoản 2 Điều 360 Bộ luật Hình sự.
Trước đó, phóng viên TTXVN và một số cơ quan báo chí đã phản ánh tình trạng các cánh rừng tự nhiên, có chức năng phòng hộ ở đầu nguồn sông Trà Bương, Tiểu khu 162, xã Sơn Hội, huyện Sơn Hòa bị tàn phá; nhiều diện tích rừng tại các xã Sơn Định, Sơn Long cũng bị chặt hạ. Các cơ quan chức năng của tỉnh Phú Yên đã vào cuộc, điều tra từng bước làm rõ những sai phạm.
Ngày 16/9, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an huyện Sơn Hòa đã khởi tố vụ án hủy hoại rừng xảy ra tại Tiểu khu 162, thôn Tân Thành, xã Sơn Hội với diện tích 30.172m2 và vụ phá rừng tại khoảnh 6, Tiểu khu 170 thôn Hòa Ngãi, xã Sơn Định với diện tích 80,760m2 để điều tra theo quy định tại khoản 3, Điều 243, Bộ luật Hình sự 2015.
Ngày 28/9/2021, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Phú Yên cũng đã khởi tố bị can và thi hành lệnh bắt tạm giam đối với Trần Quốc An, Trần Văn Kin (cùng trú xã Sơn Định, huyện Sơn Hòa) và Lê Đồng Tánh (trú xã An Xuân, huyện Tuy An) về tội "Hủy hoại rừng" do đã phá hủy 5 ha rừng khu vực Hòn Đót. Vụ việc đang được tiếp tục điều tra, làm rõ.