Vào thời điểm trên, xe taxi mang biển kiểm soát 90A-040.76 do tài xế Đỗ Thị Lan (trú ở xã Thi Sơn, huyện Kim Bảng, Hà Nam) điều khiển chở bà Hoàng Thị Duyên (sinh năm 1925) và ông Lại Duy Thông (sinh năm 1965) cùng trú ở xã Liêm Chung, thành phố Phủ Lý, băng qua đường sắt. Đoạn đường giao cắt đường bộ với đường sắt này không có rào chắn. Xe taxi đã bị tàu hỏa SE9 có đầu máy D19E-929 đi theo hướng Bắc - Nam đâm phải và kéo lê khoảng 100m.
Cú đâm mạnh đã khiến bà Hoàng Thị Duyên tử vong tại chỗ, còn tài xế Đỗ Thị Lan và ông Lại Duy Thông bị thương nhẹ. Tại hiện trường chiếc xe ô tô taxi bị hư hỏng nặng. Vụ tai nạn đã khiến đoàn tàu bị chậm lại gần 1 tiếng đồng hồ.
Nguyên nhân vụ tai nạn đang được các cơ quan chức năng điều tra, làm rõ.