Theo đó, 9 bị cáo có đơn kháng cáo bản án sơ thẩm gồm: Trương Tuấn Dũng (sinh năm 1960, nguyên Phó Chủ tịch Thường trực Ủy ban nhân dân huyện Mường La, kiêm Chủ tịch Hội đồng bồi thường, hỗ trợ tái định cư huyện Mường La, nguyên Phó Giám đốc Sở Tài chính tỉnh Sơn La); Phan Tiến Diện (sinh năm 1975, nguyên Phó Chủ tịch Ủy ban nhân dân huyện Mường La, nguyên Phó Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Sơn La); Phan Đức Chính (sinh năm 1961), nguyên Trưởng phòng Tài nguyên và Môi trường huyện Mường La; Phan Xuân Khoa (sinh năm 1974, nguyên Phó Trưởng ban di dân huyện Mường La); Trần Mạnh Trì (sinh năm 1977, nguyên Phó Trưởng ban di dân huyện Mường La); Tòng Văn Thành (sinh năm 1979, nguyên Bí thư Đảng ủy xã Chiềng Hoa, huyện Mường La); Ngô Xuân Vân (sinh năm 1965, nguyên cán bộ Phòng Tài nguyên và Môi trường huyện Mường La); Đèo Văn Ban (sinh năm 1956, nguyên Phó Bí thư Chi bộ bản Co Chai, xã Mường Chùm, huyện Mường La); Đỗ Tiến Đồng (sinh năm 1978, nguyên Giám đốc Trung tâm Kỹ thuật tài nguyên và môi trường, Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Sơn La).
Các bị cáo không kháng cáo nhưng được triệu tập đến phiên tòa cũng có mặt gồm: Lê Quang Duy, Nguyễn Văn Thanh, Mai Văn Quang, Bùi Văn Tân, Vũ Hồng Giang, Triệu Ngọc Hoan, Sòi Ngọc Hùng, Cà Văn Tỉnh.
Những người có quyền lợi, nghĩa vụ liên quan gồm: Ủy ban nhân dân huyện Mường La, Ban quản lý Dự án di dân tái định cư huyện Mường La, Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Sơn La, Văn phòng Đăng ký đất đai (Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Sơn La).
Trong phần xét xử sáng 26/11, thẩm phán, chủ tọa phiên tòa đã thông qua bản tóm tắt nội dung vụ án. Theo cáo trạng, năm 2005, công tác chi tiền bồi thường, hỗ trợ di dời cho các hộ dân trong khu vực Nhà máy Thủy điện Sơn La đã hoàn thành. Năm 2013, Chính phủ cho phép bồi thường thêm phần chênh lệch giá trị đất giữa nơi đi và nơi đến tại khu tái định cư Tân Lập.
Năm 2014, Ủy ban nhân dân tỉnh Sơn La ra Công văn số 617 chỉ đạo Ủy ban nhân dân huyện Mường La thống kê lại diện tích đất của từng hộ và đề xuất phương án bồi thường, hỗ trợ. Năm 2014, bị cáo Trương Tuấn Dũng, khi đó là Phó Chủ tịch Thường trực Ủy ban nhân dân huyện Mường La, kiêm Chủ tịch Hội đồng bồi thường, hỗ trợ tái định cư đã ký ban hành Kế hoạch số 41 để thực hiện chỉ đạo của tỉnh Sơn La, cho phép Văn phòng Đăng ký đất đai và Công ty cổ phần tư vấn và đo đạc Bảo Bình có trụ sở tại Hà Nội, đo đạc, lập bản đồ địa chính.
Khi triển khai Kế hoạch 41, tại Sơn La xuất hiện nhiều đơn thư vượt cấp, đặc biệt là đơn của Đèo Văn Ban, một cá nhân nằm trong diện được đền bù, đã gây ảnh hưởng xấu tới an ninh trật tự, buộc cơ quan Công an phải điều tra.
Qua xác minh cho thấy có sai phạm trong việc ban hành Kế hoạch 41 cũng như công tác đo đạc, lập bản đồ bồi thường cho các hộ dân, trong đó có hộ Đèo Văn Ban. Việc này dẫn tới hộ Đèo Văn Ban được bồi thường sai hơn 1,2 tỷ đồng. Cơ quan tố tụng xác định, việc bị báo Trương Tuấn Dũng đã ký ban hành và tổ chức thực hiện Kế hoạch số 41 không đúng với các văn bản hướng dẫn, chỉ đạo của Ủy ban nhân dân tỉnh Sơn La, Bộ Tài nguyên và Môi trường là nguyên nhân trực tiếp dẫn tới sai phạm trong công tác đo đạc, lập bản đồ địa chính, thu hồi đất phục vụ bồi thường, hỗ trợ. Các bị cáo khác dù biết Kế hoạch số 41 trái với các văn bản hướng dẫn, chỉ đạo của Ủy ban nhân dân tỉnh Sơn La, Bộ Tài nguyên và Môi trường nhưng vẫn thực hiện dẫn đến việc thất thoát ngân sách Nhà nước số tiền lớn.
Trước đó, tại phiên tòa sơ thẩm diễn ra vào ngày 30/7/2017, Hội đồng xét xử đã tuyên phạt 13 bị cáo tội "Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng" theo Điều 165 Bộ luật Hình sự năm 1999 và 4 bị cáo tội "Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng" theo Điều 285 Bộ luật Hình sự năm 1999. Cụ thể hình phạt như sau: Các bị cáo Trương Tuấn Dũng, Phan Tiến Diện, Phan Đức Chính mức án 6 năm, 6 tháng tù; Phan Xuân Khoa, Tòng Văn Thành mức án 5 năm 6 tháng tù; Trần Mạnh Trì mức án 5 năm tù; Ngô Xuân Vân, Lê Quang Duy, Nguyễn Văn Thanh, Đèo Văn Ban mức án 4 năm tù; Mai Văn Quang, Vũ Hồng Giang, Triệu Ngọc Hoan, Sòi Ngọc Hùng, Cà Văn Tỉnh mức án 36 tháng tù, nhưng cho hưởng án treo; Đỗ Tiến Đồng mức án 36 tháng tù; Bùi Văn Tân 30 tháng tù.
Về trách nhiệm dân sự: Bị cáo Đèo Văn Ban phải bồi thường cho Nhà nước số tiền 1,179 tỷ đồng và hoàn trả cho Nhà nước số tiền hơn 64 triệu đồng.