Giãn cách theo Chỉ thị 16, xã An Phú thực hiện theo nguyên tắc gia đình cách ly với gia đình, thôn cách ly với thôn, xã cách ly với xã, người dân ở tại nhà, chỉ ra ngoài khi thật sự cần thiết như mua lương thực, thực phẩm, thuốc men, cấp cứu; các cơ sở sản xuất, cơ sở kinh doanh dịch vụ, hàng hóa thiết yếu không bị đóng cửa, dừng hoạt động; thực hiện nghiêm Thông điệp 5K của Bộ Y tế; giữ khoảng cách tối thiểu 2 mét khi giao tiếp, không tập trung quá 2 người trở lên tại nơi công cộng, ngoài phạm vi công sở, trường học, bệnh viện, trường hợp ra khỏi nhà phải đeo khẩu trang, rửa tay bằng xà phòng hoặc dung dịch sát khuẩn.
Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố Tuy Hòa yêu cầu toàn thể nhân dân xã An Phú tự giác chấp hành các yêu cầu, các biện pháp phòng chống dịch, tích cực tham gia khai báo y tế tự nguyện, thực hiện đầy đủ các biện pháp tự bảo vệ bản thân, gia đình mình và tham gia có trách nhiệm với các hoạt động phòng, chống dịch. Chính quyền xã An Phú phối hợp với các cơ quan chức năng thiết lập vùng cách ly y tế (phong tỏa) tại cụm dân cư, thôn thuộc xã An Phú đối với các khu vực có trường hợp F0 theo phương châm "4 tại chỗ"; tổ chức thực hiện cách ly y tế phải đảm bảo an ninh, an toàn, trật tự, truyền thông, hậu cần và an sinh xã hội trong vùng cách ly với mục đích ngăn chặn lây lan dịch COVID-19. Thời gian cách ly tối thiểu 15 ngày, tùy theo diễn biến tình hình dịch mà thời gian cách ly có thể kéo dài.
Trước đó, để ngăn chặn dịch COVID-19 trong cộng đồng, thàn phố Tuy Hòa đã thực hiện giãn cách xã hội theo Chỉ thị 15, áp dụng giãn cách xã hội theo Chỉ thị 16 đối với xã Bình Kiến.
Cùng ngày 1/7, Ủy ban nhân dân huyện Tuy An quyết định giãn cách xã hội theo Chỉ thị 16 của Thủ tướng Chính phủ đối với xóm Ngoài, thôn Diêm Hội, xã An Hòa Hải trong vòng 15 ngày do trên đia bàn xã đã ghi nhận hai trường hợp dương tính với SARS-CoV-2.
Đến sáng 1/7, Phú Yên đã ghi nhận 150 ca dương tính với SARS-CoV-2, riêng thành phố Tuy Hòa 107 ca.