Theo Quyết định số 03/QĐ-KTNN, Trưởng ban là Tổng Kiểm toán nhà nước.
Phó Trưởng ban thường trực là Phó Tổng Kiểm toán nhà nước phụ trách Thanh tra Kiểm toán nhà nước.
Phó Trưởng ban gồm: Phó Tổng Kiểm toán nhà nước phụ trách Văn phòng Kiểm toán nhà nước, Phó Tổng Kiểm toán nhà nước phụ trách Vụ Tổng hợp.
Thành viên gồm: Chánh Văn phòng Kiểm toán nhà nước; Vụ trưởng Vụ Tổ chức cán bộ; Chánh Thanh tra Kiểm toán nhà nước; Vụ trưởng Vụ Tổng hợp; Vụ trưởng Vụ Chế độ và Kiểm soát chất lượng kiểm toán; Vụ trưởng Vụ Pháp chế; Trưởng phòng Phòng Tổng hợp, Thanh tra Kiểm toán nhà nước - Thư ký.
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ giúp Tổng Kiểm toán nhà nước chỉ đạo thực hiện công tác phòng, chống tham nhũng, lãng phí, tiêu cực trong hoạt động của Kiểm toán nhà nước theo quy định của Luật Phòng, chống tham nhũng, Luật Thực hành tiết kiệm, chống lãng phí và các quy định khác có liên quan.
Nhiệm vụ cụ thể của các thành viên Ban Chỉ đạo do Trưởng ban phân công. Giao Thanh tra Kiểm toán nhà nước là đơn vị đầu mối tham mưu, giúp việc Ban Chỉ đạo.
Quyết định này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 3/01/2025.
Quyết định này thay thế Quyết định số 1260/QĐ-KTNN ngày 17/6/2024 của Tổng Kiểm toán nhà nước về việc kiện toàn Ban Chỉ đạo phòng, chống tham nhũng, tiêu cực của Kiểm toán nhà nước.