Tuy nhiên, tại một số địa phương đã xuất hiện đường dây tổ chức đưa người nước ngoài nhập cảnh trái phép bằng đường bộ, đường biển, đường không, với nhiều hình thức thủ đoạn tinh vi như cho người vào thùng hàng, toa hàng, công-ten-nơ để nhập cảnh qua các cửa khẩu… ảnh hưởng không nhỏ tới công tác phòng, chống dịch COVID-19 ở nước ta.
Thực hiện ý kiến chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ, Bộ Quốc phòng giao Cục Điều tra hình sự Bộ Quốc phòng, Viện Kiểm sát Quân sự Trung ương, Cục Bảo vệ an ninh Quân đội thành lập các đoàn công tác phối hợp với các cơ quan chức năng tổ chức điều tra, xác minh làm rõ đường dây đưa người nhập cảnh trái phép vào Việt Nam. Đồng thời, giao Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng, Bộ Tư lệnh Cảnh sát biển, các quân khu quán triệt sâu sắc chỉ thị của Thủ tướng Chính phủ, chỉ thị của Bộ trưởng Bộ Quốc phòng đến cán bộ, chiến sĩ nâng cao ý thức trách nhiệm, tổ chức tuần tra, kiểm soát chặt chẽ các tuyến biên giới, kiên quyết ngăn chặn không để người từ nước ngoài nhập cảnh trái phép.
Ngoài ra, tổ chức tuần tra, kiểm soát toàn bộ khu vực biên giới, các tổ chốt, nhất là các địa bàn nghi ngờ có người nhập cảnh trái phép, kiên quyết bảo vệ an toàn toàn tuyến biên giới; phối hợp chặt chẽ với lực lượng Công an sớm đưa các vụ án tổ chức cho người nhập cảnh trái phép vào Việt Nam, ra xét xử công khai, đúng pháp luật. Các đơn vị tích cực tuyên truyền gương người tốt, việc tốt trong công tác đấu tranh phòng, chống tội phạm trên tuyến biên giới đất liền, trên biển và trong nội địa; chủ động đấu tranh, phản bác quan điểm sai trái của các thế lực thù địch về đường lối, quan điểm của Đảng, Nhà nước và Quân đội trong nhiệm vụ phòng, chống dịch COVID-19.