Theo Trung tâm Dự báo Khí tượng thuỷ văn quốc gia, hồi 10 giờ ngày 6/9, vị trí tâm siêu bão ở vào khoảng 19,3 độ Vĩ Bắc; 112,0 độ Kinh Đông, cách đảo Hải Nam (Trung Quốc) khoảng 130km về phía Đông Đông Nam; cách Quảng Ninh khoảng 570km về phía Đông Đông Nam. Sức gió mạnh nhất vùng gần tâm siêu bão mạnh cấp 16 (184 - 201km/giờ), giật trên cấp 17, di chuyển theo hướng Tây, tốc độ 15 - 20km/giờ.
Dự báo đến 22 giờ ngày 6/9, bão di chuyển theo hướng Tây Tây Bắc, tốc độ 15 - 20km/giờ, vị trí bão tại 19,9N-110,1E; trên đất liền phía Bắc đảo Hải Nam, cách Quảng Ninh khoảng 350km về phía Đông Đông Nam, cường độ bão mạnh cấp 15, giật trên cấp cấp 17; vùng nguy hiểm là phía Bắc vĩ tuyến 17,0N; phía Tây kinh tuyến 114,0E, cấp độ rủi ro thiên tai cấp 4, khu vực chịu ảnh hưởng phía Tây Bắc của khu vực Bắc Biển Đông; Cấp 3: phía Đông của khu vực Bắc vịnh Bắc Bộ.
Đến 10 giờ ngày 7/9, bão di chuyển theo hướng Tây Tây Bắc, tốc độ 15 - 20km/giờ, đi vào Bắc vịnh Bắc Bộ, vị trí bão tại 20,8N-107,8E; trên vùng biển các tỉnh Quảng Ninh - Nam Định, cường độ bão mạnh cấp 12 - 13, giật cấp 15; vùng nguy hiểm phía Bắc vĩ tuyến 18,0N; phía Tây kinh tuyến 111,5E, cấp độ rủi ro thiên tai cấp 4, khu vực chịu ảnh hưởng phía Đông của khu vực Bắc vịnh Bắc Bộ, cấp độ rủi ro thiên tai cấp 3, khu vực chịu ảnh hưởng phía Tây của khu vực Bắc vịnh Bắc Bộ và Nam vịnh Bắc Bộ.
Đến 10 giờ ngày 8/9, bão di chuyển theo hướng Tây Tây Bắc, tốc độ khoảng 20km/giờ, đi vào đất liền và suy yếu và tan dần, vị trí bão tại 21,9N-103,0E; trên khu vực phía Tây Bắc Bộ, cường độ bão dưới cấp 6, cấp độ rủi ro thiên tai cấp 4, khu vực chịu ảnh hưởng vùng biển ven bờ và đất liền Quảng Ninh, Hải Phòng, cấp độ rủi ro thiên tai cấp 3 với khu vực vịnh Bắc Bộ, vùng biển ven bờ và đất liền các tỉnh, Thái Bình, Nam Định, Ninh Bình và Thanh Hoá.
Do ảnh hưởng của bão số 3, vùng biển phía Tây Bắc của khu vực Bắc Biển Đông có gió mạnh cấp 11 - 14, vùng gần tâm siêu bão đi qua cấp 15 - 16, giật trên cấp 17; biển động dữ dội.
Từ khoảng chiều ngày 6/9, vùng biển phía Đông của vịnh Bắc Bộ (bao gồm huyện đảo Bạch Long Vỹ) có gió mạnh dần lên cấp 6 - 7. Từ tối và đêm 6/9, khu vực vịnh Bắc Bộ (bao gồm huyện đảo Bạch Long Vỹ, Cô Tô) gió mạnh dần lên cấp 8 - 9, sau tăng lên cấp 10 - 11, vùng gần tâm bão đi qua cấp 12 - 14, giật cấp 17; biển động dữ dội.
Trên đất liền, từ đêm 6/9 và gần sáng ngày 7/9, vùng ven biển từ Quảng Ninh đến Thanh Hoá có gió mạnh dần lên cấp 6 - 7, sau tăng lên cấp 8 - 9, vùng gần tâm bão cấp 10 - 12, giật cấp 14; khu vực sâu trong đất liền phía Đông Bắc Bộ có gió mạnh cấp 6 - 8, giật cấp 9 - 11 (Thời điểm gió mạnh nhất trong khoảng từ sáng đến chiều tối ngày 7/9).
Vùng biển phía Tây Bắc của khu vực Bắc Biển Đông có sóng biển cao 7 - 9m, vùng gần tâm siêu bão 10 - 12m. Biển động dữ dội.
Từ chiều ngày 6/9, khu vực vịnh Bắc Bộ (bao gồm huyện đảo Bạch Long Vỹ, Cô Tô) sóng cao 2 - 4m, sau tăng lên 3 - 5m, vùng gần tâm bão đi qua 6 - 8m.
Từ đêm 6/9 và gần sáng ngày 7/9, vùng biển ven bờ từ Quảng Ninh đến Thanh Hoá sóng cao 2 - 3m, sau tăng lên 2 - 4m, vùng gần tâm bão 3 - 5m.
Các chuyên gia cảnh báo, khu vực ven biển từ Thanh Hoá đến Quảng Ninh cần đề phòng nước dâng do bão cao từ 0,5m (Thanh Hoá)-1,8m (Quảng Ninh) vào chiều và đêm ngày 7/9 và nước rút do bão, khoảng 0,5m (Thanh Hoá)-1,0m (Quảng Ninh) xuất hiện vào sáng ngày 7/9.
Các khu vực neo đậu tàu thuyền, khu nuôi trồng thuỷ sản, các tuyến đê, kè biển trong vùng nguy hiểm nói trên đều có khả năng chịu tác động của gió mạnh, sóng lớn và nước dâng/rút do bão. Các khu vực trũng, thấp ở ven biển, cửa sông đề phòng nguy cơ ngập do nước dâng và sóng lớn.
Ngày 6/9, ở khu vực phía Đông Bắc Bộ, khu vực từ Thanh Hoá-Thừa Thiên Huế có mưa dông do tác động vành ngoài hoàn lưu bão số 03.
Từ đêm 6/9 đến sáng 9/9, ở khu vực Bắc Bộ và Thanh Hoá có khả năng xuất hiện một đợt mưa lớn với tổng lượng mưa phổ biến từ 100 - 350mm, có nơi trên 500mm (mưa lớn nhất ở phía Đông Bắc Bộ tập trung trong ngày và đêm 7/9; phía Tây Bắc Bộ từ tối ngày 7/9 đến đêm 8/9).
Mưa lớn có khả năng gây ra tình trạng ngập úng tại các vùng trũng, thấp; lũ quét trên các sông, suối nhỏ, sạt lở đất trên sườn dốc.
Do ảnh hưởng của hoàn lưu bão rộng, cần đề phòng nguy cơ xảy ra dông, tố, lốc và gió giật mạnh trước khi bão đổ bộ.