Đáng chú ý, bệnh nhân mắc viêm màng não do não mô cầu có tỷ lệ tử vong cao, từ 10-15%, tỷ lệ khuyết tật lâu dài là từ 11-19%. Trong khi đó, 50% bệnh nhân lại là trẻ dưới 2 tuổi.
Hiện nay, tiêm phòng vắc xin và vệ sinh sạch sẽ là biện pháp phòng bệnh được xem là hiệu quả.