Trước đó, vào lúc 17 giờ 30 phút ngày 15/5, lực lượng chức năng của Bộ Tư lệnh Vùng Cảnh sát biển 3 chủ trì phối hợp với Đoàn Trinh sát số 2 (Bộ Tư lệnh Cảnh sát biển) và Hải đội 3, Cục Điều tra chống buôn lậu (Tổng Cục Hải quan) tiến hành kiểm tra tàu BT-99900-TS tại vùng biển cách Đông Nam Côn Đảo khoảng 120 hải lý.
Tại thời điểm kiểm tra, tàu BT-99900-TS đang vận chuyển khoảng 90.000 lít dầu DO không có hóa đơn, chứng từ chứng minh nguồn gốc hợp pháp; trên tàu có 4 thuyền viên, do ông Võ Văn Tiếng (SN 1970, quê tỉnh Tiền Giang) làm thuyền trưởng.