Tiêu chuẩn ISO 27001 giúp quản lý an ninh thông tin một cách hiệu quả nhất. Thông tin ở đây bao gồm những dữ liệu được lưu lại dưới dạng điện tử và dữ liệu đã được in ra (dữ liệu mềm và dữ liệu cứng). Thông qua việc áp dụng ISO 27001, ZaloPay xác định được các mối nguy, rủi ro có thể xảy ra đối với từng loại thông tin, sau đó thiết lập hệ thống, thiết lập sự kiểm soát cũng như các quy trình để giảm thiểu các rủi ro đó.
Ngoài chứng nhận ISO 27001, ZaloPay còn đáp ứng các tiêu chuẩn an toàn bảo mật của Ngân hàng Nhà nước, chứng chỉ bảo mật quốc tế PCI-DSS.