Tổng kim ngạch thương mại hai chiều giữa Việt Nam và Malaysia trong năm 2021 đạt 12,58 tỷ USD, tăng gần 26% so với năm 2020 cho dù chịu nhiều ảnh hưởng của đại dịch COVID-19. Năm 2022, kim ngạch thương mại song phương tiếp tục tăng lên 14,94 tỷ USD, cho thấy sự gia tăng nhu cầu hàng hóa và dịch vụ cũng như những nỗ lực trong việc tăng cường hợp tác kinh tế giữa hai quốc gia. Thương mại song phương giữa Việt Nam và Malaysia trong năm 2023 đạt 12,67 tỷ USD, giảm so với năm trước trong bối cảnh kinh tế toàn cầu suy yếu, sự gián đoạn chuỗi cung ứng và áp lực từ lạm phát.
Mặc dù vậy, sự điều chỉnh này không làm giảm đi tầm quan trọng của Malaysia trong chiến lược thương mại của Việt Nam, đặc biệt trong giai đoạn Việt Nam đang mở rộng quan hệ kinh tế với các đối tác trong khu vực. Trong 10 tháng đầu năm 2024, thương mại song phương giữa Việt Nam và Malaysia tiếp tục ghi nhận tín hiệu tích cực với kim ngạch đạt 11,81 tỷ USD, tương đương khoảng 93% so với cả năm 2023.