Theo Ban quản lý đường sắt đô thị, sau khi hoàn tất việc thi công đổ bê tông toàn bộ sàn đỉnh nhà ga trung tâm Bến Thành dịp 30/4, nhà thầu đã triển khai thi công san lấp, nhằm tái lập hoàn trả mặt bằng nhà ga; trong đó khoan cắt tường vây bao quanh nhà ga đã triển khai từ ngày 4/6, dự kiến kéo dài trong 2 tháng. Khi phá dỡ đỉnh tường vây hoàn thành, Ban Quan lý sẽ phối hợp với các đơn vị chuyên ngành triển khai thi công tái lập hệ tống hạ tầng kỹ thuật khu vực trung tâm thành phố, phấn đấu hoàn trả mặt bằng trước 31/12.
Gói thầu CP1a từ ga Bến Thành - ga Nhà hát Thành phố, bao gồm nhà ga ngầm Bến Thành và đoạn hầm metro dài 515m, hiện đạt tổng tiến độ khoảng 89,75%. Nhà ga ngầm Bến Thành dài 236m, rộng 60m, sâu khoảng 32m, quy mô 4 tầng, bao gồm sảnh chờ, sảnh đã thu phí, lối lên xuống, văn phòng, phòng nghỉ của nhân viên, phòng cơ học, phòng điện, phòng quạt thông gió…
Tầng 1 là nơi tích hợp trung tâm thương mại ngầm với diện tích khoảng 45.000 m2, gồm khu vực cửa hàng thương mại rộng 18.100 m2, hành lang và quảng trường ngầm rộng 21.500 m2. Điểm nhấn tầng này là kết nối với mặt bằng đường phía trên với khoảng hở hình tròn nằm giữa trung tâm nhà ga, có chức năng đưa ánh sáng tự nhiên xuống ga ngầm. Công trình sau khi hoàn thành sẽ được lắp kính trong suốt để che mưa, nắng.
Tại tầng 2, hệ thống cầu thang đang được công nhân khẩn trương thi công. Khu vực này có sân ga - nơi tàu đón và trả khách, văn phòng kiểm soát, phòng thiết bị phòng cháy chữa cháy - bơm cấp nước, phòng thiết bị hút, thông gió. Tầng hầm 3 gồm phòng xử lý không khí, phòng cấp điện, phòng nghỉ của nhân viên... với các hạng mục đang dần hình thành. Trong khi đó, tầng hầm 4 là sân ga, nơi tàu đón và trả khách, với các công trình phụ như hệ thống điện, thông gió, hàng rào... đang trong giai đoạn thi công.
Được khởi công từ năm 2016, ga trung tâm Bến Thành quận 1 giống như một khu phố ngầm, trải dài đến ga Nhà hát Thành phố theo trục đường Lê Lợi xuống mặt đất. Theo thiết kế, Nhà ga Bến Thành có 6 lối lên xuống tại các khu vực Công viên 23/9, Công trường Quách Thị Trang, đường Phan Chu Trinh, lối vào tầng hầm của dự án khu tứ giác Bến Thành, giao lộ Lê Lai - Huỳnh Thúc Kháng - Hàm Nghi.
Nhà ga Bến Thành là ga ngầm chính phục vụ lượng lớn hành khách của tuyến metro số 1 Bến Thành - Suối Tiên và là điểm trung chuyển kết nối các tuyến metro số 2 Bến Thành - Tham Lương, metro số 3a Bến Thành - Tân Kiên và tuyến metro số 4 Thạnh Xuân - Khu đô thị Hiệp Phước.