Theo đó, UBND tỉnh Thừa Thiên - Huế đồng ý cho phép Công ty cổ phần Đầu tư thủy điện miền Trung Việt Nam được tích nước hồ chứa Thủy điện Thượng Nhật đến cao trình +114m theo như phương án của chủ đầu tư đưa ra và được các cơ quan chức năng đồng ý.
Tuy nhiên, tỉnh Thừa Thiên - Huế yêu cầu Công ty cổ phần Đầu tư thủy điện miền Trung Việt Nam thường xuyên liên hệ với Đài Khí tượng thủy văn tỉnh, Ban chỉ huy Phòng chống thiên tai và Tìm kiếm cứu nạn tỉnh về công tác thông tin, cảnh báo, dự báo thời tiết để vận hành công trình đảm bảo an toàn.
Định kỳ báo cáo với Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn, UBND huyện Nam Đông để chỉ đạo phối hợp điều tiết nước cho vùng hạ du, cũng như chính quyền và nhân dân các xã phía thượng lưu, hạ lưu nhà máy để đảm bảo an toàn trong quá trình sinh hoạt, sản xuất.
Về diện tích đất thuộc Vườn quốc gia Bạch Mã chưa được xác định nên phía công ty tuyệt đối chỉ được phép tích nước đến cao trình +114 không làm ngập đất của Vườn quốc gia Bạch Mã. Công ty cổ phần Đầu tư thủy điện miền Trung Việt Nam chịu hoàn toàn trách nhiệm trước pháp luật về công tác vệ sinh lòng hồ; thực hiện quan trắc chất lượng nước hồ chứa trước, sau khi tích nước, báo cáo bằng văn bản gửi Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh để theo dõi, giám sát; thực hiện quan trắc đập, kiểm định an toàn đập trong quá trình vận hành theo quy định; triển khai thi công việc xử lý mỏm đá phía hạ lưu đập tràn, hoàn thành trước mùa mưa bão năm 2021…
Trong quá trình tích nước vận hành, nếu Công ty cổ phần Đầu tư thủy điện miền Trung Việt Nam vi phạm một trong các yêu cầu trên sẽ bị thu hồi văn bản cho phép tích nước, cũng như bồi thường các chi phí, thiệt hại do vi phạm các cam kết trên.
Trước đó, cuối tháng 11/2020, Chủ tịch UBND tỉnh Thừa Thiên-Huế Phan Ngọc Thọ đã gửi 2 công văn tới Bộ Công Thương, Bộ Tài nguyên và Môi trường với nội dung đề nghị thu hồi giấy phép hoạt động điện lực và giấy phép khai thác sử dụng nước mặt đối với Công ty cổ phần Đầu tư thủy điện miền Trung Việt Nam, chủ đầu tư dự án Thủy điện Thượng Nhật trên địa bàn xã Thượng Nhật, huyện Nam Đông, tỉnh Thừa Thiên-Huế.
Nguyên nhân do Nhà máy Thủy điện Thượng Nhật chưa đủ điều kiện để xem xét cho tích nước, nhưng trong đợt mưa bão cuối năm 2020 chủ hồ không duy trì cửa van ở trạng thái mở hoàn toàn, không tuân thủ quy trình vận hành hồ chứa và không tuân thủ theo lệnh điều hành vận hành hồ chứa của UBND tỉnh Thừa Thiên - Huế.