Theo cơ quan chức năng, việc khởi tố, bắt tạm giam đối với các bị can nói trên nằm trong quá trình mở rộng điều tra về các sai phạm xảy ra tại Dự án "Nhân rộng mô hình sản xuất rau, quả trong nhà màng theo tiêu chuẩn VietGAP" và Dự án nhà màng nông nghiệp ở Trung tâm ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai do Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai quản lý.
Trước đó, Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Đồng Nai đã thi hành kỷ luật ông Nguyễn Ngọc Phương bằng hình thức khiển trách. Với cương vị là Ủy viên Thường vụ Đảng ủy, Phó Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh, ông Nguyễn Ngọc Phương khi được giao tiếp quản và quản lý Dự án “Nhân rộng mô hình sản xuất rau, quả trong nhà màng theo tiêu chuẩn VietGAP” đã thiếu trách nhiệm trong kiểm tra, rà soát vị trí xây dựng cụ thể các khối nhà màng của dự án.
Cụ thể: Ông Nguyễn Ngọc Phương đã không kiểm tra, đánh giá nội dung, tiến độ thực hiện, khối lượng công việc theo hợp đồng mà chỉ đánh giá căn cứ vào quy định kiểm tra định kỳ và báo cáo tiến độ của Trung tâm ứng dụng Công nghệ sinh học để xác lập biên bản. Do đó, ông Nguyễn Ngọc Phương đã không phát hiện và ngăn chặn kịp thời những hành vi vi phạm pháp luật trong phạm vi trực tiếp được phân công phụ trách; không chủ động nghiên cứu, chỉ đạo phòng chuyên môn tham mưu thành lập Hội đồng khoa học tư vấn kiểm tra, sơ kết quá trình thực hiện của các dự án theo quy định.
Cũng liên quan đến vụ việc này, vào tháng 2/2021, Cơ quan Cảnh sát điều tra - Công an tỉnh Đồng Nai đã ra quyết định khởi tố vụ án, khởi tố bị can đối với Phạm Văn Sáng (nguyên Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai) để điều tra về hành vi vi phạm quy định trong đầu tư công trình xây dựng gây hậu quả nghiêm trọng. Tuy nhiên, sau khi ra quyết định khởi tố, xác định đối tượng này đã bỏ trốn sang nước ngoài, Công an tỉnh đã báo cáo Văn phòng Cơ quan Cảnh sát điều tra - Bộ Công an đề nghị Tổ chức Cảnh sát hình sự quốc tế (Interpol) ra quyết định truy nã quốc tế. Hiện đối tượng Sáng vẫn chưa bị bắt.
Sau đó, Cơ quan Cảnh sát điều tra - Công an tỉnh Đồng Nai cũng đã khởi tố, bắt tạm giam đối với Nguyễn Quang Tuấn (nguyên Giám đốc Trung tâm ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai) để điều tra về hành vi vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát lãng phí.
Theo cơ quan chức năng, trong quá trình thực hiện Dự án "Nhân rộng mô hình sản xuất rau, quả trong nhà màng theo tiêu chuẩn VietGAP" và Dự án nhà màng nông nghiệp ở Trung tâm ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai (tại địa bàn huyện Cẩm Mỹ), Phạm Văn Sáng với vai trò là Giám đốc Sở Khoa học và Công nghệ Đồng Nai và Nguyễn Quang Tuấn là Giám đốc Trung tâm ứng dụng công nghệ sinh học Đồng Nai đã gây thất thoát số tiền hơn 27 tỷ đồng.
Liên quan đến những sai phạm này, vào tháng 7/2020, Ban Bí thư Trung ương Đảng đã thi hành kỷ luật bằng hình thức khai trừ Đảng đối với ông Phạm Văn Sáng.