Quyết định khởi tố bị can này căn cứ theo kết quả kiểm tra, xác minh ban đầu đã xác định: Trong quá trình Cơ quan Cảnh sát điều tra (C44) Bộ Công an thụ lý, điều tra vụ án Trương Huy Liệu và đồng phạm về tội “Buôn lậu”, “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, ông Phan Văn Vĩnh đã chỉ đạo việc ra quyết định xử lý vật chứng và tổ chức bán đấu giá lô gỗ vật chứng của vụ án trái với quy định của pháp luật, gây thiệt hại đến lợi ích của Nhà nước, quyền, lợi ích hợp pháp của tổ chức, cá nhân, làm ảnh hưởng xấu đến an ninh, trật tự, an toàn xã hội.
Bị can Phan Văn Vĩnh hiện là phạm nhân đang chấp hành án tại Trại giam Phú Sơn 4, Bộ Công an theo Quyết định Thi hành án phạt tù số 05/2019/QĐ-CA ngày 9/1/2019 của Tòa án nhân dân tỉnh Phú Thọ.