Đây là kết luận điều tra bổ sung thứ 3 của Cơ quan An ninh điều tra theo yêu cầu của Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố.
Theo nội dung vụ án, 10 bị can bị đề nghị truy tố là Tất Thành Cang (cựu Phó Bí thư Thường trực Thành ủy Thành phố Hồ Chí Minh), Trần Công Thiện (nguyên Tổng Giám đốc Công ty Xây dựng Tân Thuận), Nguyễn Văn Minh (nguyên Chủ tịch Hội đồng thành viên Công ty Xây dựng Tân Thuận), Trần Tấn Hải (nguyên Phó Tổng Giám đốc Công ty), Nguyễn Thị Ngọc Bích (nguyên Kế toán trưởng Công ty), Nguyễn Hoàng Việt (nguyên Kiểm soát viên Công ty), Nguyễn Xuân Tùng (nguyên Trưởng phòng Kinh doanh tổng hợp), Phạm Văn Thông (nguyên Phó Chánh Văn phòng Thành ủy Thành phố Hồ Chí Minh), Huỳnh Phước Long (nguyên Trưởng phòng Quản lý đầu tư kinh doanh vốn, Văn phòng Thành ủy), Phan Thanh Tân (nguyên Phó Chánh Văn phòng Thành ủy) cùng về tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát lãng phí” theo Điều 219 Bộ luật Hình sự.
Bị can Trần Công Thiện đã có hành vi tổ chức và thực hiện không đúng quy định về xây dựng giá dẫn đến giá trị chuyển nhượng phần đất đã đền bù tại Dự án khu dân cư Phước Kiển không đảm bảo nguyên tắc thị trường, công khai, minh bạch gây thất thoát tiền của Nhà nước. Tại Dự án khu dân cư ven sông, bị can Thiện có sai phạm trong việc chuyển nhượng 45% trong 55% vốn góp không đúng quy định dẫn đến giá chuyển thấp, gây thiệt hại nguồn vốn của Đảng bộ Thành phố tại Công ty. Bị can Nguyễn Văn Minh đã có hành vi họp bàn, thống nhất giá chuyển nhượng với Trần Công Thiện và trực tiếp ký văn bản gửi Văn phòng Thành ủy xin chủ trương chuyển nhượng 45% trong 55% vốn góp với giá được xây dựng không đúng quy định. Các bị can còn lại là cán bộ Công ty Xây dựng Tân Thuận bị đề nghị truy cứu trách nhiệm hình sự liên quan đến hành vi trên.
Bị can Tất Thành Cang, cựu Phó Bí thư Thường trực Thành ủy đã có hành vi không báo cáo Ban Thường vụ Thành ủy mà tự ý cho chủ trương để cấp dưới thực hiện chuyển nhượng phần đất đã đền bù tại Dự án khu dân cư Phước Kiển với giá được xây dựng không đúng quy định dẫn đến giá trị chuyển nhượng thấp, gây thất thoát số tiền lớn của Đảng bộ Thành phố tại Công ty. Các bị can Phạm Văn Thông, Phan Thanh Tân, Huỳnh Phước Long có trách nhiệm cùng với bị can Tất Thành Cang.
Theo yêu cầu điều tra bổ sung ngày 14/4/2022, Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh trả hồ sơ, yêu cầu điều tra bổ sung về 2 nội dung. Thứ nhất là xác định chính xác tài sản của Công ty Xây dựng Tân Thuận tại thời điểm Công ty này và Công ty cổ phần Quốc Cường Gia Lai ký hợp đồng chuyển nhượng một phần dự án Khu dân cư ven sông vào tháng 11/2017 và thời điểm khởi tố vụ án vào tháng 12/2019. Thứ hai là tiến hành trưng cầu giám định của các cơ quan liên quan về việc UBND Thành phố Hồ Chí Minh ban hành Quyết định 6171/QĐ-UBND ngày 23/11/2017 có đúng quy định của pháp luật không, từ đó có cơ sở xác định trách nhiệm của các cá nhân thuộc UBND Thành phố trong việc đề xuất, duyệt ban hành quyết định này.
Theo Cơ quan điều tra, tháng 6/2017, Công ty Xây dựng Tân Thuận đã chuyển nhượng 32 ha đất tại Dự án khu dân cư Phước Kiển cho Công ty cổ phần Quốc Cường Gia Lai với giá 1,29 triệu đồng/m2, gây thiệt hại cho Nhà nước 215,5 tỉ đồng. Đến tháng 11/2017, Công ty Xây dựng Tân Thuận đã chuyển nhượng toàn bộ khu đất 32.967 m2 đất thuộc khu IV Dự án khu dân cư ven sông (phường Tân Phong, Quận 7) cho Công ty cổ phần Quốc Cường Gia Lai với giá 20 triệu đồng/m², gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 283 tỉ đồng. Tổng thiệt hại vụ án là hơn 498,5 tỉ đồng.
Từ đó cho thấy, sau khi điều tra bổ sung lần thứ ba, thiệt hại của vụ án đã tăng thành 498,5 tỉ đồng. Hồ sơ vụ án đang được Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh tiếp tục giải quyết.