Lực lượng chức năng đã khám xét nơi làm việc, nơi ở và áp dụng biện pháp ngăn chặn cấm đi khỏi nơi cư trú đối với Phạm Văn Biên. Quyết định khởi tố đã được Viện Kiểm sát nhân dân cùng cấp phê chuẩn.
Theo tài liệu của cơ quan Công an, năm 2018, Phạm Hùng Dũng (sinh năm 1960, nguyên Chủ tịch UBND thị trấn Ngọc Lặc) và Lê Ngọc Tùng (sinh năm 1964, nguyên cán bộ địa chính) biết rõ diện tích đất của 4 hộ dân tại phố Trần Phú nằm trong phạm vi quy hoạch đường Hồ Chí Minh và nguồn gốc đất là đất của Trường Đảng và Trường Trung học cơ sở thị trấn 2 do UBND thị trấn Ngọc Lặc quản lý, không đủ điều kiện để được cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất.
Tuy nhiên, hai người này vẫn chỉ đạo lập hồ sơ đề nghị UBND huyện Ngọc Lặc cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất cho 4 hộ không đúng trình tự, quy định; lập khống về nguồn gốc đất. Khi Phạm Hùng Dũng và Lê Ngọc Tùng trình hồ sơ lên để Phạm Văn Biên (thời điểm đó là Giám đốc Văn phòng đăng ký quyền sử dụng đất huyện Ngọc Lặc) và Bùi Xuân Quang (sinh năm 1983, chuyên viên) xét duyệt thì không có biên bản, phiếu lấy ý kiến khu dân cư, không niêm yết công khai biên bản họp xét duyệt tại khu phố; không kiểm tra thực địa… Phạm Văn Biên vẫn đề nghị UBND huyện Ngọc Lặc cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, gây thiệt hại trên 1 tỷ đồng cho Nhà nước.
Trước đó, Công an tỉnh Thanh Hóa đã khởi tố, bắt tạm giam Phạm Hùng Dũng và Lê Ngọc Tùng.
Vụ việc đang tiếp tục được điều tra, làm rõ.