Cùng với ông Lê Huy Toàn, hai bị can khác cũng bị khởi tố là Lương Như Giáp, cán bộ Phòng Tài chính Kế hoạch và Võ Mỹ, cán bộ Phòng Quản lý đô thị thành phố Nha Trang, với cùng tội danh “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”.
Trong ngày 28/11, cả ba bị can đã bị Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Khánh Hòa khám xét nhà riêng và nơi làm việc, tống đạt lệnh cấm đi khỏi nơi cư trú.
Ông Lê Huy Toàn đảm nhiệm chức vụ Chủ tịch Hội đồng Bồi thường hỗ trợ và cấp đất tái định cư Dự án Khu đô thị Hoàng Long, phường Phước Long, thành phố Nha Trang, do Công ty trách nhiệm hữu hạn Một thành viên Đầu tư xây dựng - địa chất UPGC làm chủ đầu tư. Cơ quan Cảnh điều tra Công an tỉnh Khánh Hòa đang điều tra một số sai phạm trong dự án khu đô thị này.
Trước đó, tháng 10/2018, Cơ quan Cảnh sát Điều tra, Công an tỉnh Khánh Hòa cũng đã khởi tố vụ án và khởi tố bị can đối với bà Vũ Thị Mai Hương, nguyên chủ tịch UBND phường Phước Long (thời điểm bị khởi tố là cán bộ Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam thành phố Nha Trang) và ông Nguyễn Đức Cường, cán bộ địa chính phường Phước Long (Nha Trang) để điều tra về hành vi "Vi phạm quy định về bồi thường, hỗ trợ, tái định cư khi nhà nước thu hồi đất" theo Điều 230 Bộ luật Hình sự 2015.
Liên quan đến sai phạm tại dự án Khu đô thị Hoàng Long, tháng 12/2017, Công an tỉnh Khánh Hòa đã khởi tố, bắt tạm giam Đỗ Thế Vinh và Nguyễn Ngọc Khánh, đều là nhân viên của Công ty trách nhiệm hữu hạn Một thành viên Đầu tư xây dựng - địa chất UPGC, là thành viên tổ công tác của Hội đồng bồi thường, hỗ trợ, tái định cư Khu đô thị Hoàng Long, do liên đới đến việc giả mạo một số hồ sơ để nhận chế độ bồi thường, hỗ trợ tái định cư trong dự án đô thị này.