Trước đó, Cơ quan Công an đã khởi tố, bắt tạm giam ông Nguyễn Văn Lâm (Chi cục Hải quan Cửa khẩu Cảng Sài Gòn khu vực 1) và ông Trần Thanh Tùng (công chức Chi cục Hải quan Chuyển phát nhanh; trước đó ông Tùng làm việc tại Đội thủ tục hàng hóa nhập khẩu - Chi cục Hải quan cảng Sài Gòn khu vực 1). Những cán bộ hải quan này được xác định liên quan vụ "biết mất" của 213 container hàng tạm nhập tái xuất.
Qua công tác nghiệp vụ, Tổng cục Hải quan phát hiện vào giữa năm 2015 có 213 container của 56 doanh nghiệp vận chuyển quá cảnh qua cảng Cát Lái (Thành phố Hồ Chí Minh - cửa khẩu nơi đi) để trung chuyển bằng đường bộ, sau đó xuất đi Campuchia (cửa khẩu nơi đến). Tuy nhiên, số container trên đã được doanh nghiệp vận chuyển khỏi cảng Cát Lái nhưng không được đưa đến cửa khẩu xuất theo quy định.
Theo Tổng cục Hải quan, các công chức trên đã lợi dụng chức trách nhiệm vụ được giao, cố ý không thực hiện đúng các quy định của ngành Hải quan, tiếp tay cho một số đối tượng lợi dụng chính sách trung chuyển, quá cảnh hàng hóa để nhập hàng cấm từ nước ngoài vào tiêu thụ tại Việt Nam. Các cán bộ này biết nhưng không thực hiện đúng chức trách, nhiệm vụ được giao, không quản lý theo quy định của Tổng cục Hải quan gây hậu quả nghiêm trọng.
Hiện Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an tiếp tục làm việc với nhiều cán bộ, công chức hải quan khác có liên quan tới 213 container hàng "biến mất", mở rộng điều tra vụ án.