Bà Ngô Thị Điều là người được Hội đồng đấu giá quyền sử dụng đất khu dân cư phía Bắc của Khu đô thị Nam thành phố Tuy Hòa ký Quyết định công nhận là người trúng đấu giá khu đất số 1 (262 lô đất) và được Chi nhánh Văn phòng đăng ký đất đai thành phố Tuy Hòa cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất đối với 262 lô đất.
Theo điều tra ban đầu, do am hiểu về Luật Thuế, bà Ngô Thị Điều đã sử dụng Hợp đồng chuyển nhượng quyền sử dụng đất có giá trị chuyển nhượng không đúng với thực tế, tài liệu không hợp pháp để cơ quan thuế xác định sai số tiền thuế phải nộp, mục đích là giảm số tiền thuế phải nộp. Dựa trên bảng giá đất do UBND tỉnh Phú Yên ban hành, bà Điều đã tự đặt ra bảng giá đối với 262 lô đất trên và đưa vào lập Hợp đồng chuyển nhượng quyền sử dụng đất.
Tuy nhiên, trong quá trình chuyển nhượng bà Điều dựa vào nhu cầu của thị trường để quyết định tăng hoặc giảm giá đất. Tính từ thời điểm bắt đầu chuyển nhượng bà Điều đã tăng giá 3 lần, mỗi lần tăng khoảng từ 500.000 đồng - 1.000.000 đồng/m2 tùy vào vị trí thửa đất. Giá đất chuyển nhượng trên thực tế tăng, nhưng giá trị chuyển nhượng ghi trên Hợp đồng chuyển nhượng quyền sử dụng đất vẫn giữ nguyên theo giá đã xây dựng ban đầu.
Với thủ đoạn trên từ ngày 7/8/2017 đến tháng 9/2020, bà Ngô Thị Điều đã chuyển nhượng 259 thửa đất với tổng giá trị chuyển nhượng ghi trên Hợp đồng hơn 157 tỷ đồng, nhưng thực tế bà Điều đã bán 259 thửa đất này với tổng số tiền là hơn 320 tỷ đồng, chênh lệch tăng so với số liệu trên hợp đồng là hơn 158 tỷ đồng, nhằm giảm số tiền thuế phải nộp, gây thất thu số tiền thuế phải nộp khi chuyển nhượng bất động sản trên 2 tỷ đồng.
Liên quan đến vụ việc, ngày 4/6, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an tỉnh Phú Yên đã Quyết định khởi tố bị can và bắt tạm giam 3 tháng với ông Nguyễn Chí Hiến (sinh năm 1960), nguyên Phó Chủ tịch Thường trực UBND tỉnh Phú Yên và bà Nguyễn Thị Nở (sinh năm 1964), nguyên Phó Giám đốc Sở Tài chính về tội “Vi phạm quy định về quản lý sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí”, theo khoản 3, Điều 219, Bộ luật Hình sự năm 2015.
Ngày 24/8/2021, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an tỉnh Phú Yên đã quyết định khởi tố 3 bị can gồm Mai Hắc Lợi (59 tuổi, Phó Giám đốc Sở Tư pháp tỉnh Phú Yên), Ngô Quang Phú (41 tuổi, Phó Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Phú Yên) và Nguyễn Ngọc Duy (45 tuổi, Phó Cục trưởng Cục Thuế tỉnh Phú Yên). Ba người này bị khởi tố vì đã thống nhất cùng ông Nguyễn Chí Hiến - nguyên Phó Chủ tịch Thường trực UBND tỉnh Phú Yên nhiệm kỳ 2016-2021 giảm tiền bán đấu giá 262 lô đất ở liền kề của khu đô thị mới Nam Tuy Hòa không đúng quy định pháp luật, gây thiệt hại tài sản Nhà nước hơn 8 tỷ đồng.