Theo cáo trạng, khoảng 10 giờ ngày 6/7/2021, mười can phạm nhân tại Trại tạm giam Chí Hòa có dấu hiệu sốt, ho, khó thở, trong đó có bị cáo Nguyễn Văn Trọng, được các quản giáo đưa đi khám bệnh tại Bệnh viện Chí Hòa (trong khuôn viên Trại tạm giam Chí Hòa). Tuy nhiên, khi đến Bệnh viện Chí Hòa, các can phạm nhân không hợp tác, không tuân thủ theo y lệnh của bác sĩ bệnh viện và đòi các yêu sách, tiêu chuẩn riêng trong khám chữa bệnh, nên cán bộ quản giáo dẫn giải các can phạm nhân trở lại buồng giam.
Chiều cùng ngày, có 2 can phạm nhân bên trong buồng giam báo khó thở, cán bộ quản giáo vào kiểm tra và đưa 2 can phạm nhân này đi cấp cứu tại Bệnh viện Chí Hòa. Lợi dụng lúc này, một số can phạm nhân đang đứng ngoài hành lang bắt đầu la hét, kích động cho rằng cán bộ quản giáo không tổ chức khám, chữa bệnh cho các phạm nhân bị mắc COVID-19 nên dẫn đến bị bệnh nặng phải đi cấp cứu.
Trong nhóm gây rối, Nguyễn Văn Trọng và Trần Tuấn Hải có thái độ chống đối, không chấp hành mệnh lệnh của quản giáo, phá ổ khóa của một số buồng giam khác để 60 can phạm nhân trong các buồng giam ra khỏi nơi giam giữ nhằm tiếp tục gây rối. Tiếp đó, Nguyễn Văn Trọng, Trần Tuấn Hải còn phá khóa nhiều buồng giam khác để nhiều can phạm nhân ra ngoài nhằm la hét, chống đối Đội quản giáo. Đến khoảng 20 giờ ngày 6/7/2021, Công an TP Hồ Chí Minh cùng lực lượng chức năng khống chế, đưa các can phạm nhân chống đối về buồng giam, ổn định lại tình hình. Sau đó, Cơ quan điều tra khởi tố vụ án, khởi tố bị can đối với Trọng, Hải.