Theo đó, 86 bị cáo trong vụ án bị Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao truy tố về các tội danh gồm: Tham ô tài sản; Đưa hối lộ; Nhận hối lộ; Vi phạm quy định về hoạt động ngân hàng, hoạt động khác liên quan đến hoạt động ngân hàng; Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ; Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng; Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản, theo Bộ luật Hình sự 2015 và Vi phạm quy định về cho vay trong hoạt động của các tổ chức tín dụng theo Bộ luật Hình sự 1999.
Trong đó, bị cáo Trương Mỹ Lan, Chủ tịch Tập đoàn Vạn Thịnh Phát bị truy tố 3 tội danh: Tham ô tài sản, Đưa hối lộ theo quy định tại khoản 4 Điều 353, khoản 4 Điều 364 Bộ luật Hình sự năm 2015, sửa đổi, bổ sung năm 2017; Vi phạm quy định về cho vay trong hoạt động của các tổ chức tín dụng quy định tại khoản 3 Điều 179 Bộ luật Hình sự năm 1999 với khung hình phạt cao nhất là tử hình.
Bị cáo Trương Mỹ Lan cũng bị xét xử về tội Đưa hối lộ vì đã có hành vi hối lộ Đoàn Thanh tra của Ngân hàng Nhà nước để che giấu, bưng bít các sai phạm của bị cáo và Ngân hàng SCB, tạo điều kiện cho SCB được tái cơ cấu.
Ngoài tư cách bị cáo, Trương Mỹ Lan còn hầu tòa với tư cách bị hại trong vụ án bị cáo Nguyễn Cao Trí, Chủ tịch Hội đồng Quản trị Công ty Cổ phần đầu tư và quản lý giáo dục Văn Lang - Chủ tịch Hội đồng quản trị kiêm Tổng Giám đốc Công ty Capella bị xét xử về tội Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản vì có hành vi tìm cách chiếm đoạt của bị cáo Trương Mỹ Lan 1.000 tỷ đồng.
Trong số 85 bị cáo còn lại, có 16 bị cáo trong vụ án là cựu cán bộ Cơ quan Thanh tra, giám sát ngân hàng (thuộc Ngân hàng Nhà nước), cựu cán bộ Ngân hàng Nhà nước - Chi nhánh Thành phố Hồ Chí Minh bị truy tố về tội Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Về tội nhận hối lộ, Viện Kiểm sát nhân dân Tối cao truy tố bị cáo Đỗ Thị Nhàn, cựu Cục trưởng Cục Thanh tra, giám sát ngân hàng II thuộc Ngân hàng Nhà nước.
45 bị cáo là cựu lãnh đạo, cán bộ Ngân hàng SCB; 7 bị cáo thuộc Công ty thẩm định giá bị truy tố về các tội: Tham ô tài sản; Vi phạm quy định về hoạt động của ngân hàng, hoạt động khác liên quan đến hoạt động ngân hàng.
Bị cáo Nguyễn Cao Trí, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị Công ty Cổ phần đầu tư và quản lý giáo dục Văn Lang - cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị kiêm Tổng Giám đốc Công ty Capella bị truy tố về tội lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản, khi tìm cách chiếm đoạt của bị cáo Trương Mỹ Lan 1.000 tỷ đồng.
Bên cạnh việc cáo buộc hành vi phạm tội của các bị cáo, cáo trạng của Viện Kiểm sát nhân dân ghi nhận các tình tiết giảm nhẹ của các bị cáo.
Theo đó, trong quá trình điều tra, truy tố, trừ bị cáo Trương Mỹ Lan và 5 bị cáo bị truy tố, xét xử vắng mặt, 80 bị cáo còn lại trong vụ án đều ăn năn hối cải, thành khẩn khai nhận hành vi phạm tội, phù hợp với các tài liệu, chứng cứ đã điều tra, thu thập trong hồ sơ vụ án.
Nhiều bị cáo đã phối hợp, tích cực hợp tác, giúp cơ quan tố tụng điều tra làm rõ bản chất của vụ án như Võ Tấn Hoàng Văn (cựu Tổng Giám đốc Ngân hàng SCB), Trương Huệ Vân (cháu gái của bị cáo Trương Mỹ Lan, Tổng Giám đốc Tập đoàn Vạn Thịnh Phát), Trần Thị Mỹ Dung (cựu Phó Tổng Giám đốc Ngân hàng SCB); Chu Lập Cơ (chồng bị cáo Trương Mỹ Lan), Đỗ Thị Nhàn (cựu Cục trưởng Cục Thanh tra, giám sát Ngân hàng II, Cục II, Cơ quan Thanh tra, giám sát ngân hàng, Ngân hàng Nhà nước)...
Nhiều bị cáo đã tự nguyện hoặc tác động gia đình nộp tiền, tài sản để khắc phục hậu quả do hành vi phạm tội của bản thân gây ra như: Gia đình bị cáo Bùi Anh Dũng, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị Ngân hàng SCB nộp 4,5 tỷ đồng; gia đình bị cáo Phan Tấn Trung, cựu Phó Chánh Thanh tra, giám sát Ngân hàng Nhà nước chi nhánh Thành phố Hồ Chí Minh nộp 546 triệu đồng. Bị cáo Nguyễn Thanh Tùng, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị Công ty Cổ phần Dầu khí Đông Phương nộp 500 triệu đồng. Các bị cáo Phạm Mạnh Cường, cựu Giám đốc Phòng Tái thẩm định, Ngân hàng SCB và Cao Việt Dũng, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị Công ty Trách nhiệm hữu hạn Thương mại và Sản xuất Tường Việt cùng nộp 200 triệu đồng mỗi bị cáo.
Một số bị cáo có thành tích xuất sắc trong công tác như: Nguyễn Văn Hưng, cựu Phó Chánh Thanh tra Phụ trách Cơ quan Thanh tra, giám sát Ngân hàng Nhà nước (Huân chương Lao động hạng Nhì); Nguyễn Văn Du, cựu quyền Chánh Thanh tra, Cơ quan Thanh tra, giám sát ngân hàng, Ngân hàng Nhà nước (Huân chương Lao động hạng Nhất, hạng Nhì, hạng Ba); Nguyễn Cao Trí, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị Công ty Cổ phần đầu tư và quản lý giáo dục Văn Lang, cựu Chủ tịch Hội đồng Quản trị kiêm Tổng Giám đốc Công ty Capella (Huân chương Lao động hạng Ba, Bằng khen)…
Một số bị cáo xuất thân trong gia đình chính sách, có công với cách mạng như Nguyễn Văn Thanh Hải, Võ Thành Tùng, Diệp Bảo Châu, Võ Văn Tường, Nguyễn Anh Thép… Riêng bị cáo Nguyễn Văn Thanh Hải còn là quân nhân phục vụ tại Campuchia.
Cạnh đó, Viện Kiểm sát xem xét về sức khỏe của các bị can bị bệnh, là người già, sức khỏe yếu như bị cáo Uông Văn Ngọc Ẩn, Nguyễn Thị Phương Loan, Võ Thành Hùng, Nguyễn Phi Long, Lưu Quốc Thắng.
Các bị cáo trong vụ án đều có nhân thân tốt, phạm tội lần đầu. Nhiều bị cáo tích cực tham gia các hoạt động từ thiện, phòng, chống dịch, đóng góp cho cộng đồng như Dương Tấn Trước, Trương Mỹ Lan, Nguyễn Cao Trí.
Sau khi công bố xong cáo trạng, Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh thông báo, với các tình tiết giảm nhẹ của các bị cáo chưa được ghi nhận trong cáo trạng, Viện Kiểm sát sẽ tiếp tục ghi nhận trong quá trình luận tội.
Kết thúc ngày xét xử thứ 2, Hội đồng xét xử thông báo trong phiên xử sáng mai sẽ bắt đầu xét hỏi hành vi phạm tội của bị cáo Trương Mỹ Lan và đồng phạm, trừ bị cáo Nguyễn Cao Trí do hành vi phạm tội của bị cáo Trí là độc lập, không liên quan các bị cáo khác, nếu cần sẽ triệu tập sau.