Theo JOC, đoàn thể thao của nước chủ nhà sẽ có 582 vận động viên, trong đó có 306 nam và 276 nữ, thi đấu ở tất cả 33 môn. Đây là đoàn thể thao đông nhất của Nhật Bản từng tham dự Olympic. Các kỷ lục trước đó được ghi nhận vào năm 1964 khi có 355 vận động viên Nhật Bản tham dự Olympic cũng tại Tokyo. Nếu tính cả các quan chức, đoàn thể thao Nhật Bản sẽ có tổng cộng 1.058 người, vượt xa so với kỷ lục trước đó là 601, được ghi nhận tại Olympic 2016 ở Rio de Janeiro.
JOC cho biết vận động viên bóng rổ Rui Hachimura và nữ vận động viên đấu vật Yui Susaki dự kiến sẽ là những người cầm cờ cho đoàn thể thao Nhật Bản. Họ sẽ dẫn đầu đoàn thể thao Nhật Bản diễu hành vào Sân vận động Quốc gia tại lễ khai mạc Olympic vào ngày 23/7 tới.
Tuần trước, JOC đã quyết định cử vận động viên chạy nước rút Ryota Yamagata, người đang nắm giữ kỷ lục quốc gia Nhật Bản ở cự ly 100m nam, là đội trưởng của đoàn thể thao nước này. Yamagata dự kiến sẽ tuyên thệ trong lễ khai mạc cùng với nữ vận động viên bóng bàn Kasumi Ishikawa, người được giao chức đội phó.