Cục Hải quan Hà Nội đang triển khai 4 nhóm giải pháp nhằm hoàn thành nhiệm vụ thu ngân sách nhà nước, gồm: cải cách thủ tục hành chính, triển khai thủ tục hải quan điện tử; tăng cường đối thoại, tháo gỡ khó khăn, vướng mắc cho doanh nghiệp về thủ tục xuất nhập khẩu; triển khai các biện pháp tạo thuận lợi về thông quan hàng hóa...
Bên cạnh đó, cơ quan hải quan tiếp tục triển khai dự án hiện đại hóa, thực hiện thu ngân sách liên thông giữa cơ quan thuế - kho bạc - hải quan và bảo lãnh thuế với ngân hàng thương mại bằng phương thức điện tử, đồng thời tăng cường khai thác và tăng thu từ công tác chống gian lận qua áp mã, giá hàng hóa, hàng tạm nhập tái xuất, kiểm tra các dự án đầu tư có số hoàn thuế lớn, kiểm tra sau thông quan, chống buôn lậu, gian lận thương mại.
Theo Cục Hải quan Hà Nội, đầu tháng 4/2013, cơ quan này đã tổ chức hội nghị đối thoại với 36 đại lý làm thủ tục hải quan, bàn biện pháp thúc đẩy hoạt động xuất nhập khẩu, góp phần tăng thu ngân sách nhà nước. Hiện nay, do địa bàn Hà Nội nằm sâu trong nội địa, hàng hóa làm thủ tục hải quan chủ yếu bằng phương thức chuyển tiếp từ các cảng biển, cửa khẩu đường bộ về Hà Nội (chiếm ,3% tổng thu ngân sách).