Theo thống kê ban đầu, tại thị trấn Mèo Vạc (huyện Mèo Vạc), mưa to kéo dài suốt từ đêm 10 đến ngày 12/9 khiến lượng nước lớn từ các triền núi đổ về trung tâm huyện Mèo Vạc. Do lượng nước đổ về quá lớn, hệ thống cống rãnh không kịp thoát nước nên tràn ra đường phố khiến gần 100 ngôi nhà của bà con nhân dân và công sở bị nước tràn vào nhà gây ngập úng cục bộ. Nhiều trang thiết bị, vật dụng, phương tiện đi lại của người dân bị ảnh hưởng nghiêm trọng.
Mưa lũ lớn đã khiến nhiều diện tích cây hoa màu như cây ngô vụ 2, khoai lang bị thiệt hại. Nước lũ cũng cuốn trôi nhiều tài sản của bà con nhân dân. Mưa lũ cũng gây ra một hố có đường kính khoảng gần 40 mét, sâu khoảng 20 mét tại khu vực thôn Chúng Pả B thuộc thị trần Mèo Vạc và có nguy cơ tiếp tục xảy ra sụt lún nếu trời vẫn mưa kéo dài. Nhiều tuyến đường quốc lộ từ trung tâm huyện Mèo Vạc đi các xã biên giới như Sơn Vĩ, Thượng Phùng, Xín Cái bị sạt lở nghiêm trọng, hàng trăm mét khối đất đá tràn xuống đường quốc lộ khiến giao thông đi lại rất khó khăn.
Tại địa bàn thôn Phố Cáo, xã Đồng Yên (huyện Bắc Quang), mưa lớn kéo dài nhiều giờ đã khiến nước dâng ngập sâu tỉnh lộ 183 làm tê liệt giao thông cục bộ. Hàng trăm hộ dân ở đây cùng nhiều tài sản, hoa màu bị ảnh hưởng nghiêm trọng.
Không chỉ ở địa bàn huyện Mèo Vạc và huyện Bắc Quang, mưa lớn kéo dài nhiều giờ cũng khiến nhiều tuyến đường giao thông đi vào xã Thuận Hòa (huyện Vị Xuyên) bị sạt lở nghiêm trọng. Tại Km12 tuyến đường quốc lộ từ xã Tân Lập (huyện Bắc Quang) đi huyện Hoàng Su Phì mưa lớn kéo dài nhiều giờ cũng đã gây sạt lở đất, khiến giao thông đi lại cực kỳ khó khăn. Đặc biệt, tại khu vực đập tràn thuộc xã Yên Định (huyện Bắc Mê), mưa lớn kéo dài cộng với lượng nước từ các sông, suối đổ về khiến nước lũ dâng cao, khiến các phương tiện giao thông không thể đi lại qua đây.
Trước đó, trong các ngày từ 8 đến 11/9, trên địa bàn huyện Bắc Quang (Hà Giang) đã xảy ra mưa lớn kéo dài khiến 1 người tử vong do sạt taluy dương và thiệt hại nhiều tài sản, hoa màu, nhiều công trình phúc lợi của Nhà nước và nhân dân. Vào sáng 8/9, bà Nguyễn Thị Nhật (sinh năm 19), ở thôn Minh Thượng, xã Quang Minh, huyện Bắc Quang trên đường đi chăn vịt thì bị taluy dương sạt lở vào người gây tử vong tại chỗ.
Mưa lớn kéo dài nhiều giờ khiến nhiều tuyến đường của các xã: Quang Minh, Tân Lập, Việt Hồng và thị trấn Việt Quang (huyện Bắc Quang) bị sạt lở nhiều đoạn, hàng nghìn mét khối đất đá sạt lở tràn xuống mặt đường gây ách tắc giao thông. Mưa lớn gây ngập úng cục bộ tràn vào nhà nhiều hộ dân trên địa bàn một số tổ của thị trấn Việt Quang khiến hư hỏng nhiều đồ đạc, tài sản. Đặc biệt, mưa lớn cũng khiến nhiều diện tích lúa, hoa màu và ao hồ trên địa bàn huyện bị ngập úng…
Theo ông Lê Anh Dũng, Chi cục Phó Chi cục Thủy lợi tỉnh Hà Giang: Ngay khi xảy ra mưa lũ, Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai, tìm kiếm cứu nạn tỉnh Hà Giang đã chỉ đạo lãnh đạo UBND các huyện kịp thời có mặt tại khu vực xảy ra mưa lũ để động viên nhân dân và chỉ đạo các lực lượng thực hiện 4 tại chỗ khắc phục hậu quả, đảm bảo các tuyến đường giao thông thông suốt. Đồng thời chỉ đạo các cơ quan chức năng phối hợp với UBND các huyện xác định mức độ thiệt hại, hỗ trợ giống cho các hộ bị thiệt hại khôi phục lại sản xuất; khẩn trương khơi thông hệ thống cống, rãnh thoát nước, đắp bờ ngăn nước tràn vào nhà dân; hỗ trợ cho các hộ gia đình khắc phục hậu quả thiên tai sớm ổn định cuộc sống.