Theo đó, nhóm nghiên cứu COVID-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP Hồ Chí Minh và Đơn vị Nghiên cứu lâm sàng Đại học Oxford đã tiến hành giải mã nhanh bộ gene SARS-CoV-2 từ bệnh nhân 4583 (Quận 7) là bệnh nhân có liên quan đến bệnh nhân 4514 trú tại chung cư Sunview Town (đường Gò Dưa, phường Hiệp Bình Phước, thành phố Thủ Đức) ghi nhận ngày 18/5 và bệnh nhân 4780 trong chùm ca ở Quận 3 là ba mẹ con bán bánh canh, ghi nhận ngày 20/5.
Bệnh nhân mắc COVID-19 ở Quận 3 mang biến chủng Anh, là loại biến chủng có tốc độ lây lan nhanh ở cộng đồng.
Qua phương pháp giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION; phần mềm lắp ghép bộ gene Genious, định danh biến chủng bằng phần mềm Pangolin, kết quả cho thấy mẫu từ bệnh nhân 4583 là biến chủng B.1.617.2 và mẫu từ bệnh nhân 4780 là B.1.1.7.
Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy các bộ gene thu nhận chứa các đột biến tiêu biểu của biến chủng B.1.1.7 và biến chủng B.1.617.2 tương ứng. Từ kết hợp giải mã gene với thông tin dịch tễ, nhóm nghiên cứu khẳng định bệnh nhân 4583 (Quận 7) và BN4514 (quận Thủ Đức – đã báo cáo kết quả ngày 19/5/2021) có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2, là biến chủng Ấn Độ).
Còn bệnh nhân 4780 (Quận 3) nhiễm biến chủng B.1.1.7, là biến chủng Anh đang lưu hành tại Đà Nẵng, Hà Nam và hiện nay đã lây lan ra các tỉnh khu vực miền Trung, đồng thời cũng đã phát hiện được trên bệnh nhân 1660 (từ Hải Dương, vào ngày 29/1) và bệnh nhân 2910 (từ Hà Nam, vào ngày 29/4) được cách ly điều trị tại Bệnh viện Dã chiến Củ Chi trước đây.
Theo Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP Hồ Chí Minh, đây là lần đầu tiên TP Hồ Chí Minh ghi nhận sự lưu hành đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh là biến chủng Ấn Độ và biến chủng Anh ở các ca bệnh trong cộng đồng.