Bão số 6 bắt đầu ảnh hưởng trực tiếp đến các tỉnh Bình Định, Phú Yên, Khánh Hòa, gây gió mạnh và mưa lớn từ lúc 20 giờ ngày 10/11, sau đó nhanh chóng suy yếu thành áp thấp nhiệt đới. Toàn bộ tàu thuyền của Khánh Hòa đều được tránh trú, neo đậu an toàn.
Toàn tỉnh có 2.590 bè nuôi trồng thủy sản, các hộ nuôi trồng thủy sản đã chủ động chằng, néo, di dời lồng bè đến nơi an toàn. Hơn 6.000 lao động trên các lồng bè đã di chuyển vào bờ. Riêng khu vực bè nuôi trồng thủy sản ở xã Vạn Thạnh, Vạn Ninh, thời điểm 17 giờ ngày 10/11 còn 2 ngư dân đang ở trên lồng bè nuôi cá, bị mắc kẹt lại.
Do điều kiện gió to, sóng lớn, các tàu chức năng không thể tiếp cận khu vực này để cứu nạn. Đến 21 giờ 30 phút cùng ngày, khi sóng biển tạm lắng xuống, 2 ngư dân đã bơi xuồng vào hòn đảo gần đó an toàn.
Hiện nay, mực nước trên các sông của tỉnh Khánh Hòa đều ở mức thấp, dưới mức báo động I. Dựa vào lượng mưa phổ biến từ 85-125mm từ 6 giờ ngày 10/11 đến sáng 11/11, tỉnh Khánh Hòa đã chủ động tích nước cho hệ thống hồ chứa, đưa dung tích nước chứa nâng từ 55% lên 67% so với tổng dung tích toàn bộ, đáp ứng yêu cầu tưới tiêu và cấp nước sinh hoạt, sản xuất điện thời gian tới.
Các cơ sở lưu trú, dịch vụ du lịch tại địa phương thông tin và thực hiện biện pháp đảm bảo an toàn cho du khách trước, trong và khi bão đổ bộ nên không xảy ra trường hợp đáng tiếc.
Theo thống kê sơ bộ, toàn tỉnh Khánh Hòa có hơn 100m kênh mương bị hư hỏng, 40 m đường giao thông nông thôn bị sạt lở, khoảng 350 ha lúa và hoa màu bị ngập, chủ yếu tại huyện Vạn Ninh và một phần thị xã Ninh Hòa. Ngoài ra, 10 bè nuôi trồng thủy sản bị thiệt hại, hai thuyền (dưới 30 CV) bị dứt dây khi neo đậu bị chìm.