Theo Văn phòng Ủy ban Quốc gia tìm kiếm cứu nạn (UBQG TKCN), tính đến 16 giờ 30 phút ngày 6/9, mưa lũ tại miền Trung đã làm 5 người chết (Thanh Hóa 2 người, Nghệ An 2, Hà Tĩnh 1); mất tích 1 người (Thanh Hóa); ngập 1.512 nhà (Hà Tĩnh 1.500, Quảng Bình 12); ngập 1.833 ha hoa màu và cây ăn quả (Nghệ An 373, Hà Tĩnh 1.325, Quảng Bình 135) và nhiều tuyến đường giao thông bị ngập. Riêng xã Lương Sơn, huyện Thường Xuân, tỉnh Thanh Hóa bị cô lập hoàn toàn.
Quân khu 4 đã chỉ đạo các đơn vị trực thuộc triển khai các phương án phòng chống lụt bão và tìm kiếm cứu nạn; phối hợp với địa phương kịp thời giải quyết hậu quả; chỉ đạo Bộ CHQS các tỉnh từ Thanh Hóa đến Quảng Bình thành lập đoàn công tác xuống các cơ sở để nắm và chỉ đạo công tác phòng chống và khắc phục hậu quả mưa lũ.
Hồi 9 giờ 30 phút ngày 6/9, Văn phòng Ban chỉ đạo Phòng chống lụt bão Trung ương và Văn phòng UBQG TKCN đã có Công điện số 39/CĐ-TW chỉ đạo BCH PCLB&TKCN các tỉnh Thanh Hóa, Nghệ An triển khai các phương án sẵn sàng ứng phó khi có tình huống.
Cũng theo Văn phòng UBQG TKCN, lúc 21 giờ ngày 5/9 tại khu vực cách đông bắc đảo Long Châu (Hải Phòng) khoảng 9 hải lý, tàu vận tải Hoàng Thịnh biển kiểm soát NĐ 2222 với 9 thuyền viên bị chìm chưa rõ nguyên nhân, 4 thuyền viên đã rời tàu, còn 5 thuyền viên chưa rõ đã rời tàu hay chưa. Đến 14 giờ 30 phút ngày 6/9, lực lượng cứu hộ đã cứu, vớt được 2 thuyền viên còn sống. Hiện công tác tìm kiếm 7 nạn nhân mất tích vẫn đang tiếp tục.