Lực lượng chức năng tỉnh Đồng Nai xác định sự việc xảy ra vào 8 giờ 50 phút ngày 5/2, thuyền chở khách ký hiệu ĐN-0228 do thuyền trưởng Nguyễn Trường Chinh (28 tuổi), ngụ phường Long Bình Tân, thành phố Biên Hòa điều khiển, chở theo 12 người từ hướng chùa Phước Long (người dân địa phương còn gọi là chùa Châu Đốc 3), thuộc địa bàn Cù lao Ba Sang, thành phố Thủ Đức, Thành phố Hồ Chí Minh, đến bến đò Xưa, phường Long Bình Tân, thành phố Biên Hòa để trả khách.
Khi thuyền tới Km 31+600 trên sông Đồng Nai thì xảy ra va chạm với sà lan chở container số đăng ký VL 15108 do thuyền trưởng Trần Thanh Tâm (50 tuổi), ngụ thành phố Cần Thơ điều khiển, đi từ hạ nguồn lên cảng Đồng Nai giao hàng.
Cú va chạm mạnh khiến thuyền ĐN-0288 bị lật úp, toàn bộ khách rơi xuống sông. Lúc này, lái thuyền Chinh cùng phụ lái cố gắng đẩy những người trong thuyền ra bên ngoài. Trong đó, có một nạn nhân N.T.H (đang mang thai 3 tháng) quê tỉnh Thanh Hóa, ngụ phường An Bình, thành phố Biên Hòa bị vướng vào nơi chứa áo phao và ôm vào cột sắt trên thuyền nên không cứu được, nạn nhân đã tử vong.
Chị N.T.T. (sinh năm 1986, chị gái ruột của nạn nhân) là nhân chứng trên thuyền bị rơi xuống sông được cứu sống cho biết, thời điểm trước khi xảy ra tai nạn, lái thuyền chở khách chạy quá nhanh nên khi gặp tàu chở hàng đã không kịp xử lý. Hai tàu va chạm khiến tất cả mọi người đều bị rơi xuống sông, mọi người trên tàu khi đó đều mặc áo phao.
Chiều cùng ngày, làm việc với cơ quan chức năng, thuyền trưởng sà lan VL 15108 Trần Thanh Tâm cho biết sà lan vừa rời bến khoảng 100m hướng về cảng Đồng Nai nhận hàng thì chiếc thuyền ĐN 0288 cắt ngang mũi, khiến thuyền bị lật úp dẫn tới hành khách trên thuyền rơi xuống sông. Anh Tâm đã nhanh chóng lùi sà lan ra khỏi khu vực trên và phụ giúp cứu người.