Theo Bí thư Tỉnh ủy Nguyễn Thanh Tùng, việc xây dựng khu cảng xăng dầu gây ô nhiễm cả đầm Thị Nại và ảnh hưởng lớn đến môi trường du lịch của thành phố Quy Nhơn. Nơi đây chỉ phù hợp xây dựng cảng dịch vụ tổng hợp bởi cầu cảng phải nằm sát bên trong bờ đầm để bảo vệ cảnh quan và môi trường.
Dự án khu cảng xăng dầu và kho bãi tổng hợp Bình An do Công ty cổ phần Xăng dầu Bình An làm chủ đầu tư được UBND tỉnh Bình Định có văn bản cho phép đầu tư từ năm 2014. Dự án này đã được UBND tỉnh Bình Định xin ý kiến của Bộ Giao thông Vận tải và Bộ Công Thương. Theo tiến độ đăng ký, quý IV năm 2018 dự án mới được triển khai thi công và dự kiến hoàn thành vào năm 2020.
Mặc dù chưa có thiết kế chi tiết và chưa được phê duyệt, chưa có báo cáo tác động môi trường nhưng Công ty cổ phần Xăng dầu Bình An đã huy động phương tiện đổ hàng nghìn m3 đất đá lấp đầm Thị Nại để thực hiện dự án. Việc làm này đã ảnh hưởng đến luồng lạch tàu thuyền ra vào đánh bắt thủy sản, gây ô nhiễm môi trường và bức xúc trong dư luận.
Với sai phạm này, UBND tỉnh Bình Định đã quyết định xử phạt 300 triệu đồng, đồng thời buộc Công ty cổ phần Xăng dầu Bình An phải nạo vét toàn bộ khối lượng đất đá đã đổ xuống đầm Thị Nại.