Cụ thể, đối với các hồ thủy điện, các đơn vị thực hiện nghiêm túc nội dung Quy trình vận hành liên hồ chứa được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt và Quy trình đơn hồ chứa được Bộ Công thương, UBND tỉnh phê duyệt, trong đó tập trung giám sát thực hiện việc đưa dần mực nước về cao trình đón lũ.
Đối với các hồ chứa thủy lợi, tỉnh Nghệ An yêu cầu các đơn vị sẵn sàng thực hiện phương án ứng phó đảm bảo an toàn công trình và vùng hạ du, đặc biệt là các hồ chứa xung yếu, hồ đang thi công, hồ chứa nhỏ, hồ chứa có mức trữ nước cao theo phương án đã được phê duyệt; bố trí lực lượng thường trực để vận hành và sẵn sàng xử lý các tình huống có thể xảy ra.
Tỉnh Nghệ An có 1.061 hồ đập thủy lợi lớn nhỏ các loại, trong đó có 417 hồ đang đầy nước. Nghệ An cũng có 19 hồ chứa thủy điện đang vận hành khai thác, trong đó có 8 hồ vận hành theo quy trình vận hành liên hồ chứa trên lưu vực sông Cả; các hồ còn lại vận hành theo quy trình đơn hồ.
Nếu bão số 13 gây mưa lớn tại Nghệ An, nhiều hồ chứa thủy điện và thủy lợi sẽ có mực nước vượt cao trình quy định. Để đảm bảo an toàn cho các hồ đập, các đơn vị buộc phải xả lũ. Hiện, các phương án xả lũ đã được các công ty thủy điện và thủy lợi, chính quyền các địa phương thực hiện nghiêm túc, đúng quy định đã được phê duyệt.
Ban Chỉ huy Phòng chống thiên tai và tìm kiếm cứu nạn tỉnh Nghệ An cũng yêu cầu các công ty thủy điện trước lúc xả lũ, cần kiểm tra việc cung cấp thông tin kịp thời cho vùng hạ du, tránh tình trạng để người dân và các cơ quan, đơn vị chưa hoặc không nhận được thông tin về việc xả lũ. Đối với các hồ chứa thủy lợi, không được tích nước nếu hồ không đảm bảo an toàn.