Theo cáo trạng, năm 2012, bị cáo Huy thành lập Công ty trách nhiệm hữu hạn xây dựng và vận tải Huy Hoàng (Công ty Huy Hoàng) do bị cáo làm giám đốc. Công ty của Huy kinh doanh ngành nghề buôn bán vật liệu, thiết bị lắp đặt trong xây dựng... Công ty Huy Hoàng không hoạt động kinh doanh tại địa chỉ đăng ký mà kinh doanh, mua bán cát, đá tại bãi tập kết vật liệu xây dựng ở cuối ngõ 464 đường Âu Cơ (phường Phú Thượng, quận Tây Hồ, Hà Nội). Quá trình kinh doanh, Nguyễn Tuấn Huy thường mua cát, đá của các chủ tàu hoạt động khai thác cát, đá trái phép, không có hóa đơn chứng từ. Để hợp thức hóa đơn đầu vào, với mục đích trốn thuế, Huy mua 4 hóa đơn Giá trị gia tăng của hai công ty khác với mục đích để mua bán hóa đơn với tổng số tiền hơn 2 tỷ đồng và đã trốn thuế với số tiền hơn 200 triệu đồng. Ngày 14/5/2020, Huy đã nộp khắc phục hậu quả số tiền 50 triệu đồng.