Theo đó, Hội đồng xét xử chấp nhận giảm án cho bị cáo Trần Vĩnh Tuyến (nguyên Phó Chủ tịch UBND Thành phố Hồ Chí Minh), tuyên bác kháng cáo kêu oan của bị cáo Trần Trọng Tuấn (nguyên Giám đốc Sở Xây dựng Thành phố Hồ Chí Minh).
Cụ thể, Hội đồng xét xử nhận định, bản án sơ thẩm xét xử các bị cáo là đúng người, đúng tội. Với vai trò Tổng Giám đốc SAGRI, bị cáo Lê Tấn Hùng đã chỉ đạo cán bộ trong Tổng Công ty thực hiện các hành vi trái pháp luật để chuyển nhượng Dự án khu nhà ở tại khu đất diện tích hơn 36.000m2 (Khu phố 4, phường Phước Long B, Quận 9 cũ, Thành phố Hồ Chí Minh) cho Tổng Công ty Phong Phú.
Bị cáo Hùng ký văn bản đề nghị UBND Thành phố Hồ Chí Minh chấp thuận chuyển nhượng toàn bộ Dự án cho Tổng Công ty Phong Phú; ký hợp đồng và các văn bản khác hoàn tất việc chuyển nhượng Dự án với tổng số tiền hơn 1 tỷ đồng, gây thiệt hại cho Nhà nước số tiền hơn 672 tỷ đồng. Bị cáo Trần Vĩnh Tuyến (nguyên Phó Chủ tịch UBND Thành phố), Trần Trọng Tuấn (nguyên Giám đốc Sở Xây dựng) đã có các hành vi vi phạm dẫn đến sai phạm trong việc chuyển nhượng Dự án của SAGRI cho Tổng Công ty Phong Phú.
Xét kháng cáo kêu oan của bị cáo Trần Trọng Tuấn, theo Hội đồng xét xử, quá trình điều tra, bị cáo khai nhận tội vì cho rằng do áp lực. Tại tòa phúc thẩm, bị cáo cho rằng mình không phạm tội. Hội đồng xét xử nhận định bị cáo Tuấn với vai trò Chủ tịch Hội đồng thẩm định, bị cáo buộc phải biết rõ việc chuyển nhượng dự án cần tiến hành thẩm định giá, đấu giá công khai, minh bạch. Tuy nhiên, bị cáo đã cố ý hiểu sai quy định của pháp luật, từ đó tạo điều kiện cho bị cáo Lê Tấn Hùng phạm tội, gây thất thoát tài sản của Nhà nước. Không có cơ sở chấp nhận kháng cáo, Hội đồng xét xử tuyên y án sơ thẩm, phạt bị cáo Trần Trọng Tuấn 6 năm tù về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí".
Hội đồng xét xử cũng tuyên bác kháng cáo, tuyên phạt các bị cáo Nguyễn Thị Thúy (nguyên Kế toán trưởng SAGRI) 20 năm tù cho hai tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" và "Tham ô tài sản"; Nguyễn Thị Tuyết Mai (nguyên Trưởng phòng Nhân sự hành chính SAGRI) 6 năm tù về tội “Tham ô tài sản". Hội đồng xét xử cũng tuyên bác kháng nghị về phần thiệt hại trong vụ án của Viện Kiểm sát nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh. Đối với bị cáo Hồ Văn Ngon (nguyên Phó Tổng Giám đốc SAGRI), Hội đồng xét xử tuyên đình chỉ vụ án về hình sự và án phí hình sự phúc thẩm đối với bị cáo Ngon do bị cáo đã chết vì bệnh vào ngày 1/1/2022.
Đối với kháng cáo xin giảm nhẹ hình phạt của bị cáo Trần Vĩnh Tuyến, Hội đồng xét xử nhận định, bị cáo Tuyến thừa nhận sai sót khi ký Quyết định số 6077/QĐ-UBND ngày 17/11/2017 “về chấp thuận chuyển nhượng Dự án phát triển khu nhà ở tại Khu phố 4, phường Phước Long B, Quận 9, Thành phố Hồ Chí Minh” do Tổng Công ty Nông nghiệp Sài Gòn làm chủ đầu tư cho Tổng Công ty Phong Phú. Xét các tình tiết như phạm tội có phần nể nang tin tưởng cấp dưới, hoàn cảnh phạm tội có phần hạn chế, gia đình có công với cách mạng, có đóng góp trong công tác phòng, chống dịch COVID-19 như đề nghị của Viện Kiểm sát, Hội đồng xét xử chấp nhận kháng cáo, tuyên phạt bị cáo Tuyến 5 năm tù về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí", giảm 1 năm so với án sơ thẩm.
Hội đồng xét xử chấp nhận một phần kháng cáo, tuyên bị cáo Lê Tấn Hùng (nguyên Tổng Giám đốc SAGRI) 24 năm tù cho cả hai tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" và "Tham ô tài sản", giảm 1 năm so với án sơ thẩm; tuyên phạt bị cáo Đoàn Quang Hồi (Giám đốc Công ty trách nhiệm hữu hạn Thương mại Dịch vụ Lữ hành Hòa Bình Quốc tế) 6 năm tù về tội “Tham ô tài sản", giảm 2 năm tù so với án sơ thẩm.
Trước đó ngày 18/12/2021, Tòa án nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh xét xử sơ thẩm đối với 19 bị cáo. Bên cạnh hành vi trái pháp luật để chuyển nhượng Dự án khu nhà ở tại Khu phố 4, phường Phước Long B cho Tổng Công ty Phong Phú, bị cáo Lê Tấn Hùng còn chỉ đạo và cùng các bị cáo Nguyễn Thị Thúy - Kế toán trưởng và Nguyễn Thị Tuyết Mai - Trưởng phòng Nhân sự hành chính của SAGRI bàn bạc, thống nhất với Trần Văn Trường - Giám đốc và Đỗ Sĩ Hoài Thanh - Kế toán trưởng Công ty Du lịch thanh niên xung phong; Đoàn Quang Hồi - Giám đốc và Nguyễn Thị Nguyên - Kế toán trưởng Công ty Lữ hành Hòa bình Quốc tế lập 10 hồ sơ, hợp đồng khống cho cán bộ, nhân viên SAGRI đi tham quan, học tập kinh nghiệm tại nước ngoài, chiếm đoạt hơn 13 tỷ đồng của SAGRI để sử dụng vào mục đích cá nhân.