Trong vụ tấn công đẫm máu ngày 7/1/2015, 12 người, trong đó có cả những nghệ sỹ minh họa nổi tiếng nhất tại Pháp, đã thiệt mạng khi 2 anh em tay súng Hồi giáo cực đoan Said và Cherif Kouachi xả súng vào các phòng làm việc của tòa soạn ở thủ đô Paris. Hai thủ phạm đã bị tiêu diệt tại hiện trường nhưng 14 đối tượng tình nghi là tòng phạm sẽ bị đưa ra xét xử tại thủ đô Paris vào ngày 2/9.
Trang bìa số ra mới nhất của Charlie Hebdo là hình ảnh hàng chục bức biếm họa nhà tiên tri có ảnh hưởng của thế giới Hồi giáo lần đầu được đăng trên tờ nhật báo Jyllands-Posten của Đan Mạch năm 2005, sau đó được Charlie Hebdo tái bản năm 2006. Những bức biếm họa này vấp phải sự phản đối mạnh mẽ từ cộng đồng người Hồi giáo trên thế giới. Ở giữa trang bìa là một bức biếm họa nhà tiên tri của họa sĩ Jean Cabut, nghệ danh Cabu, đã thiệt mạng trong vụ tấn công.
Nhóm biên tập cho rằng đây là lúc đưa các bức tranh biếm họa trở lại, cho rằng là "điều cần thiết" khi phiên xét xử bắt đầu. Charlie Hebdo khẳng định việc xuất bản trở lại các hình ảnh biếm họa về nhà tiên tri Mohamed không hề phạm pháp. Từ sau vụ tấn công tới nay, tòa soạn mới lại đăng những hình ảnh này bởi giờ là lúc họ có một lý do phù hợp, đưa chủ đề này trở lại diễn đàn tranh luận. Tinh thần của Charlie Hebdo dù được những người ủng hộ tự do đề cao nhưng cũng không ít người cho rằng tòa soạn đã nhiều lần "vượt giới hạn".