Công ty đường sắt Đông Nhật Bản (East Japan Railway) đã cho ngừng tất cả các tuyến tàu trong vùng thủ đô Tokyo khi bão đổ bộ thành phố Chiba lúc gần 5h sáng theo giờ địa phương. Công ty dự kiến nối lại phần lớn dịch vụ vào lúc 10h sáng sau khi kiểm tra các tuyền đường ray.
Công ty đường sắt Trung Nhật Bản (Central Japan Railway) cũng đã phải dừng tuyến tàu cao tốc giữa thủ đô Tokyo và thành phố Odawara. Một số dịch vụ đường sắt và tàu điện ngầm khác ở vùng thủ đô cũng bị đình trệ do bão.
Theo các nhà chức trách địa phương, có treeb 10 người bị thương tại khu vực Tateyama thuộc tỉnh Chiba và các vùng lân cận, 10 người khác bị thương ở thành phố Chiba, 2 người bị thương ở tỉnh Kanagawa. Ngoài ra, cơn bão cũng khiến khoảng 920.000 hộ gia đình tại các tình Chiba và Kanagawa bị mất điện tạm thời và ít nhất 10 ngôi nhà ở tỉnh Shizouka bị hư hại. Nhà chức trách đã ra lệnh sơ tán 5.000 người ở Chiba và Kanagawa, đồng thời khuyến cáo sơ tán không bắt buộc đối với trên 390.000 người.
Cơ quan khí tượng Nhật Bản cho biết, siêu bão Faxai có đường di chuyển về hướng Đông Bắc với tốc độ 25 km/h, sức gió lên tới 216 km/h. Các chuyên gia cũng cảnh báo nguy cơ sạt lở đất, ngập lụt do các trận mưa lớn gây ra. Trong 24 giờ tính đến đầu giờ sáng 9/9, siêu bão Faxai đã gây mưa lớn hơn 440 mm đổ xuống thành phố Izu ở tỉnh Shizuoka.
Trước khi đổ bộ gần thủ đô, bão Faxai đã gây gián đoạn giao thông trên đường đi qua Vịnh Tokyo, theo đó 100 chuyến tàu cao tốc nối Tokyo với các thành phố miền Trung và miền Tây Nhật Bản cũng như dịch vụ phà trên vịnh Tokyo đã bị đình chỉ hoạt động trong ngày 8/9. Các hãng hàng không đã hủy hàng trăm chuyến bay dự kiến trong ngày 9/9, trong khi một số tuyến cao tốc ven biển đã bị đóng ở Kanagawa, phía Tây thủ đô Tokyo.