Theo Liên đoàn Bóng đá Việt Nam, 11 câu lạc bộ được cấp phép tham dự Giải AFC và Giải Vô địch Quốc gia 2022 gồm: Hoàng Anh Gia Lai, Viettel, Nam Định, Đông Á Thanh Hóa, Becamex Bình Dương, Hà Nội, SHB Đà Nẵng, Hồng Lĩnh Hà Tĩnh, TP Hồ Chí Minh, Sài Gòn, Hải Phòng.
Câu lạc bộ Sông Lam Nghệ An và Bình Định được Ban Chấp hành Liên đoàn Bóng đá Việt Nam cấp phép ngoại lệ kèm theo biện pháp phạt. Cụ thể, câu lạc bộ bóng đá Sông Lam Nghệ An bị cảnh cáo và Bình Định bị khiển trách. Hai câu lạc bộ này không được cấp phép tham dự giải đấu cấp câu lạc bộ của AFC 2022.
Riêng Câu lạc bộ Than Quảng Ninh không được cấp phép tham dự giải Vô địch Quốc gia và giải đấu cấp câu lạc bộ của AFC năm 2022 do không đáp ứng các tiêu chí cấp phép hạng A bắt buộc trên hệ thống cấp phép trực tuyến và công ty TNHH 1 TV Bóng đá Quảng Ninh – đơn vị quản lý câu lạc bộ bóng đá Than Quảng Ninh tạm ngừng hoạt động.
Trước đó, vào giữa tháng 10/2021, Công ty cổ phần bóng đá chuyên nghiệp Việt Nam (VPF) đã tổ chức Hội nghị tổng kết các giải Bóng đá chuyên nghiệp quốc gia 2021. Do ảnh hưởng của dịch COVID-19, lần đầu tiên các giải bóng đá chuyên nghiệp quốc gia 2021 buộc phải tạm dừng giữa chừng.
Tính tới thời điểm dừng giải đấu, các giải bóng đá chuyên nghiệp quốc gia 2021 đã diễn ra tổng cộng 137 trận đấu, gồm có: 1 trận Siêu cúp Quốc gia 2020; 12 vòng đấu với 84 trận đấu tại Giải Vô địch Quốc gia - LS 2021; 7 vòng đấu với 41 trận đấu tại Giải hạng Nhất quốc gia - LS 2021 (1 trận đấu tại Vòng 7 bị hoãn); Vòng loại với 11 trận đấu tại Giải Cúp quốc gia Bamboo Airway 2021.
Căn cứ theo nội dung Nghị Quyết và thông báo chính thức của Liên đoàn Bóng đá Việt Nam ngày 23/9/2021, mùa giải 2021 không công nhận danh hiệu tập thể và cá nhân theo Điều lệ tại các Giải bóng đá Vô địch Quốc gia-LS 2021, Giải bóng đá hạng Nhất quốc gia-LS 2021 và Giải bóng đá Cúp quốc gia Bamboo Airways 2021. Đồng thời cũng không áp dụng suất lên-xuống hạng tại các Giải Bóng đá Vô địch Quốc gia-LS 2021 và Giải bóng đá hạng Nhất quốc gia-LS 2021. Kết quả chuyên môn của các câu lạc bộ đến hết vòng 12 Giải bóng đá Vô địch Quốc gia-LS 2021 là cơ sở để báo cáo Liên đoàn Bóng đá châu Á trong việc xác định đại diện Việt Nam tham dự các giải đấu cấp câu lạc bộ AFC năm 2022 dựa trên tiêu chuẩn cấp phép hiện hành của AFC.