Phương án phân luồng, tổ chức giao thông cụ thể như sau: Cấm tất cả các phương tiện lưu thông trên đường Yên Phụ (theo hướng từ cầu Long Biên đi cầu Nhật Tân) trên đoạn từ Cửa Bắc đến An Dương.
Các phương tiện đi từ hướng Yên Phụ đến cửa khẩu An Dương, đến đường Nghi Tàm sẽ rẽ vào cửa khẩu Tân Ấp đến đường Hồng Hà đến cửa khẩu An Dương đến đường Nghi Tàm. Các phương tiện đi từ hướng Yên Phụ về Thanh Niên, Thụy Khuê đi theo hướng: rẽ trái tại Cửa Bắc - Quán Thánh - Thụy Khuê hoặc Thanh Niên.
Các phương tiện đi từ Thanh Niên rẽ trái về Nghi Tàm đi theo hướng: Rẽ phải ra Âu Cơ quay đầu nút giao Hàng Than - rẽ vào cửa khẩu Tân Ấp - đường Hồng Hà - rẽ trái tại cửa khẩu An Dương đi Thanh Niên, Nghi Tàm hoặc đi đường Thanh Niên - rẽ trái vào Yên Phụ nhỏ (nút giao Phó Đức Chính) - Nghi Tàm.
Các phương tiện từ Thanh Niên đi cửa khẩu An Dương đi theo hướng: Rẽ phải ra Âu Cơ quay đầu nút giao Hàng Than rẽ vào Cửa khẩu Tân Ấp - đường Hồng Hà - cửa khẩu An Dương.
Tổ chức giao thông 2 chiều tạm thời cho các phương tiện lưu thông trên đường Yên Phụ nhỏ. Các phương tiện khác lưu thông bình thường.
Trong quá trình thi công, Sở Giao thông Vận tải Hà Nội yêu cầu rào chắn toàn bộ mặt đường Yên Phụ (theo hướng từ cầu Long Biên đi cầu Nhật Tân). Đồng thời rào chắn 1 phần trung tâm nút giao An Dương - Thanh Niên (có bề rộng B=12m tính từ trụ P4 và chiều dài 26m từ cửa khẩu An Dương đến dải phân cách giữa đường Yên Phụ) để bảo đảm an toàn giao thông trong quá trình thi công.
Đồng thời, tổ chức tháo tạm 8m dải phân cách giữa cửa khẩu An Dương để phục vụ các phương tiện lưu thông thuận tiện tại cửa khẩu An Dương, điều chỉnh hệ thống biển báo trên phố Yên Phụ nhỏ thành 2 chiều cho các phương tiện. Đóng điểm quay đầu trên phố Yên Phụ và khôi phục ngay sau khi hoàn thiện công tác cẩu lắp và rào chắn phân luồng giao thông.
Sở Giao thông Vận tải Hà Nội yêu cầu đơn vị thi công lắp đặt đầy đủ hệ thống biển báo, bố trí người phối hợp với các lực lượng chức năng phân luồng, hướng dẫn giao thông cho các phương tiện qua khu vực, tránh ùn tắc.