Theo Công ty CII (chủ đầu tư), nhằm hỗ trợ người dân và doanh nghiệp vượt qua khó khăn do dịch bệnh COVID-19, giá vé đã được UBND Tp. Hồ Chí Minh điều chỉnh, trong năm đầu tiên thu phí chỉ là 90% mức giá đề xuất.
Cụ thể, trong giai đoạn 1/4/2021 – 31/3/2022, mức vé thấp nhất cho xe dưới 12 ghế ngồi, xe tải có tải trọng dưới 2 tấn, các loại xe buýt vận tải khách công cộng là 25.000 đồng/lượt. Mức vé cao nhất dành cho xe tải có tải trọng trên 18 tấn, xe chở hàng bằng container 40 ft là 140.000 đồng/lượt.
Trong giai đoạn tiếp theo, mức giá vé thấp nhất theo vé lượt là 28.000 đồng/lượt với xe dưới 12 ghế ngồi, xe tải có trải trọng dưới 2 tấn, các loại xe buýt vận tải hành khách công cộng; mức giá cao nhất là 155.000 đồng/lượt với xe tải có tải trọng trên 18 tấn, xe chở hàng bằng container 40 ft.
Theo thông lệ, để đưa vào hoạt động chính thức, Trạm thu phí xa lộ Hà nội sẽ tổ chức vận hành thu phí thử nghiệm, từ 22 giờ ngày 27/3, các phương tiện đi qua trạm sẽ đi chậm, thực hiện thao tác mua vé (không thu tiền). Sau đó, chủ đầu tư sẽ chính thức thu phí vào 1/4.
Ngoài 11 đối tượng được miễn thu vé sử dụng dịch vụ đường bộ tương tự quy định của Thông tư số 35/2016/TT-BGTVT ngày 15/11/2016 của Bộ Giao thông Vận tải, Tp. Hồ Chí Minh còn chấp thuận giảm 100% giá vé đối với các loại xe buýt có tuyến cố định của thành phố lưu thông qua trạm xa lộ Hà Nội để khuyến khích người dân đi phương tiện công cộng.
Cùng với đó, Thành phố cũng chấp thuận giảm 50% giá vé cho ô tô dưới 12 ghế không sử dụng để kinh doanh của các chủ phương tiện có hộ khẩu thường trú, hoặc tạm trú dài hạn trên 6 tháng trước ngày trạm thu phí xa lộ Hà Nội đi vào hoạt động (trước ngày 1/11/2020) trên mặt đường hai tuyến đường song hành của trục xa lộ Hà Nội thuộc thành phố Thủ Đức. Chủ sở hữu sử dụng các phương tiện này phải sử dụng dịch vụ thu phí tự động không dừng (ETC) và có hồ sơ xác nhận của địa phương về cư trú và của Sở Giao thông Vận tải về việc không sử dụng phương tiện để kinh doanh.