Trước đó, tháng 8/2018, Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân huyện Bến Lức đã đưa vụ án ra xử sơ thẩm lần đầu và tuyên phạt các bị cáo gồm: Nguyễn Phước Thuận (37 tuổi), nguyên cán bộ quản giáo Trạm giam Long Hòa 3 năm 6 tháng tù; Nguyễn Minh Huân (27 tuổi), nguyên cán bộ quản giáo Trại giam Long Hòa 2 năm 6 tháng tù và Châu Minh Nhựt (23 tuổi), nguyên chiến sĩ nghĩa vụ công an 2 năm tù, cùng về tội dùng nhục hình. Đến tháng 12/2018, Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân tỉnh Long An xử phúc thẩm và đã tuyên bố hủy toàn bộ bản án sơ thẩm do bản án này vi phạm nghiêm trọng thủ tục tố tụng.
Theo Hội đồng xét xử Tòa án nhân dân tỉnh Long An, cấp sơ thẩm đã có thiếu sót nghiêm trọng trong quá trình điều tra như không thu giữ vật chứng là phương tiện mà các bị cáo dùng vào việc phạm tội là cái còng tay, ghế để kê bị hại; chưa thực hiện thực nghiệm điều tra để làm rõ hậu quả ảnh hưởng đến tính mạng của bị hại và hành vi cụ thể của các bị cáo để xác định rõ mối quan hệ về hành vi của các bị cáo đối với thiệt hại xảy ra trong quá trình phạm tội, nhất là đối với cái chết của bị hại Lại Quốc Huy (17 tuổi). Hai phạm nhân có mặt trong quá trình xảy ra vụ việc có vai trò gì chưa được làm rõ...
Tại phiên xét xử lần này, đại diện Viện kiểm sát nhân dân huyện Bến Lức đã đề nghị mức án từ 4 -5 năm tù giam đối với bị cáo Nguyễn Phước Thuận, 2-3 năm tù giam đối với hai bị cáo Nguyễn Minh Huân và Châu Minh Nhựt về Tội dùng nhục hình quy định tại Điều 298 Bộ luật Hình sự năm 1999. Tuy nhiên, đại diện bị hại yêu cầu Hội đồng xét xử xử phạt các bị cáo với mức án nặng hơn, từ 12 đến 20 năm tù.
Theo cáo trạng, Nguyễn Phước Thuận được phân công phụ trách đội 9, đội 10 gồm những phạm nhân chưa thành niên. Trong đó có các phạm nhân Châu Gia Huy, Lê Minh Long, Lê Đức Anh, Điểu Linh, Lại Quốc Huy. Do các phạm nhân có thái độ chống đối lao động, không tiếp thu sự giáo dục nên sáng 20/7/2017, đối tượng Nguyễn Phước Thuận gọi phạm nhân Lê Minh Long vào phòng làm việc trong xưởng đan ghế và bắt phạm nhân này ngồi xuống sàn, hỏi lý do vì sao trốn lao động, sau đó bắt Long nằm sấp xuống sàn, dùng gậy cao su đánh vào mông, đùi của Long. Lúc này, Châu Minh Nhựt đang có mặt tại hiện trường cũng cầm gậy đánh vào chân Long. Sau đó, Long được ra khỏi xưởng làm việc.
Sau đó, Nguyễn Phước Thuận tiếp tục gọi Châu Gia Huy, Lê Đức Anh và Điểu Linh vào phòng làm việc. Thuận và Nguyễn Minh Huân bắt từng phạm nhân nằm sấp xuống nền, dùng gậy cao su đánh liên tiếp vào mông, đùi rồi cho các phạm nhân về.
Đến khoảng 11h cùng ngày, Nguyễn Phước Thuận tiếp tục gọi Lại Quốc Huy vào phòng và hỏi tại sao trốn lao động nhưng phạm nhân này không thừa nhận nên bị Thuận đè nằm xuống sàn (trong phòng có mặt cả Huân và Nhựt). Lúc này có hai phạm nhân khác dùng còng số 8 còng hai tay Huy ra phía trước. Thuận dùng gậy cao su đánh liên tiếp vào mông, đùi Huy, sau đó đưa gậy cho Huân và Nhựt đánh liên tiếp vào mông, đùi và chân Huy. Các đối tượng dựng Huy dậy, còng hai tay vào vách lưới B40 ở tư thế dựa lưng vào lưới, giơ 2 tay cao hơn đầu, mỗi tay 1 còng, chân đứng đất. Đến khoảng 13h25 phút, Thuận phát hiện Huy ngất xỉu nên cùng mọi người tháo còng và đưa đi bệnh viện cấp cứu. Tuy nhiên, Lại Quốc Huy tử vong trên đường đến bệnh viện.
Bản kết luận giám định pháp y về tử thi xác định, Huy bị dập nhẹ hai môi, bầm tụ máu ở cổ tay, mông, đùi, dưới da đầu, não phù các mạch máu, màng não xung huyết, có chỗ xuất huyết, khoang hộp sọ ứ nhiều máu đỏ sẫm, phổi phù mặt cắt. Kết quả cận lâm sàng, nhồi máu cơ tim cấp dưới, thuyên tắc mạch phổi, phù phổi cấp dẫn đến suy tuần hoàn, suy hô hấp cấp…
Với những hành vi trên, ba bị cáo được xác định phạm vào Tội dùng nhục hình, quy định tại Điều 373, Bộ luật Hình sự năm 2015 (sửa đổi, bổ sung năm 2017). Tuy nhiên, do thời gian xảy ra vụ án Bộ luật Hình sự năm 1999 vẫn còn hiệu lực nên Viện kiểm sát nhân dân huyện Bến Lức quyết định truy tố các bị cáo theo Điều 298 của Bộ luật này.