Theo đó, hệ thống giám sát đường băng đã hiển thị màu vàng cho toàn bộ đường băng trên màn hình của kiểm soát viên không lưu và máy bay hiện màu đỏ khi có máy bay vào đường băng. Các điều tra viên sẽ xem xét khả năng kiểm soát viên không lưu đã bỏ lỡ cảnh báo trên màn hình.
Bộ trên cho biết kiểm soát viên không lưu đã không cho phép máy bay của JCG đi vào đường băng, trong khi các phi công của máy bay JAL đã nói trong một cuộc điều tra nội bộ rằng họ không thể xác nhận bằng mắt thường sự hiện diện của máy bay JCG trong quá trình hạ cánh.
Vụ va chạm giữa máy bay Airbus A350 của JAL và máy bay De Havilland Dash-8 của JCG xảy ra ngày 2/1. Tất cả 379 hành khách trên máy bay của JAL đã được sơ tán an toàn trong vòng 18 phút sau khi máy bay hạ cánh và bốc cháy dữ dội. Phi công của máy bay De Havilland Dash-8 cũng thoát hiểm an toàn, nhưng 5 thành viên phi hành đoàn trên máy bay này đã thiệt mạng.
Hiện Ủy ban An toàn Giao thông Quốc gia Nhật Bản và Sở Cảnh sát Tokyo đang tiến hành điều tra nguyên nhân vụ tai nạn, trong đó không loại trừ yếu tố do con người gây ra.