Bệnh khảm lá virus xảy ra trên các giống sắn: KM419, KM98-5, KM440, KM94, KM140… Tỷ lệ bệnh phát sinh gây hại từ 5 - 100%/cây. Diện tích sắn bị nhiễm bệnh nhẹ là 430 ha, diện tích nhiễm bệnh trung bình 5.900 ha, diện tích nhiễm bệnh nặng 8.200 ha.
Bệnh khảm lá virus gây hại trên cây sắn tập trung ở các huyện: Sông Hinh, Đồng Xuân, Sơn Hòa, Tây Hòa, Phú Hòa và Tuy An; trong đó, huyện Sông Hinh có diện tích sắn bị nhiễm bệnh khảm lá virus nhiều nhất với 5.700 ha (tỷ lệ nhiễm bệnh từ 6 - 50%/cây). Tiếp đến là huyện Đồng Xuân với diện tích sắn nhiễm bệnh là 4.200 ha (tỷ lệ nhiễm bệnh 5 - 50%/cây), huyện Sơn Hòa 3.030 ha, huyện Tây Hòa 1.400 ha, huyện Phú Hòa 100 ha, huyện Tuy An 100 ha...
Ông Nguyễn Lê Lanh Đa cho biết, bệnh khảm lá virus trên cây sắn ảnh hưởng đến sản lượng thu hoạch và hàm lượng tinh bột trong củ sắn tùy theo mức độ và thời gian nhiễm bệnh. Bệnh do virus gây ra, hiện chưa có thuốc phòng trừ nên Chi cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật tỉnh Phú Yên hướng dẫn người dân thực hiện các biện pháp kỹ thuật canh tác, chăm sóc cây sắn và phòng trừ các loại sâu bọ là trung gian gây bệnh.
Đặc biệt, giải pháp quan trọng nhất để loại trừ hoàn toàn bệnh khảm lá virus trên cây sắn là sử dụng các giống sắn mới chưa nhiễm bệnh để thay thế cho các giống sắn đã nhiễm bệnh. Hiện nay, Chi cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật tỉnh Phú Yên đang tham mưu cho UBND tỉnh khảo nghiệm một số giống sắn kháng bệnh khảm lá virus để nhân rộng cho người dân trồng.
Theo ông Nguyễn Lê Lanh Đa, hiện nay, một số giống sắn được đánh giá có khả năng kháng bệnh khảm lá virus như: HN1, HN3, HN5. Tuy nhiên, các giống này chỉ được Cục Trồng trọt công bố lưu hành giống tại khu vực Đông Nam Bộ. Do đó tỉnh Phú Yên rất khó trong việc triển khai đưa những giống mới này về địa phương để sản xuất. Các giống sắn này cũng chỉ mới được trồng khảo nghiệm trên địa bàn tỉnh và chưa nhân rộng trồng đại trà.
Chi cục Trồng trọt và Bảo vệ thực vật tỉnh Phú Yên cũng khuyến cáo người dân tuyệt đối không trồng giống sắn HL-S11 nhiễm bệnh nặng, sử dụng các giống ít nhiễm bệnh để thay thế; khi phát hiện bệnh khảm lá virus trên cây sắn phải áp dụng chặt chẽ quy trình kỹ thuật phòng trừ của Cục Bảo vệ thực vật; không được vận chuyển thân, lá sắn ra khỏi vùng nhiễm bệnh; không lấy giống từ những khu vực bị nhiễm bệnh đề trồng trên diện tích mới.
Trong thời gian qua, cây sắn được trồng tại Phú Yên thường xuyên bị bệnh khảm lá virus. Niên vụ 2018 - 2019, diện tích sắn trên toàn tỉnh bị nhiễm bệnh là 114,6 ha; niên vụ 2019 - 2020, diện tích nhiễm bệnh là 6.197 ha; đến đầu năm 2022, bệnh khảm lá virus gây hại với tổng diện tích là 9.122 ha.